TSHZ1

TSHZ1
Ідентифікатори
Символи	TSHZ1, CAA, NY-CO-33, SDCCAG33, TSH1, teashirt zinc finger homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 614427 MGI: 1346031 HomoloGene: 4227 GeneCards: TSHZ1
Пов'язані генетичні захворювання
ear canal atresia
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • зв'язування з іоном металу • chromatin binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • soft palate development • регуляція експресії генів • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • middle ear morphogenesis • multicellular organism development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1950094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10194	110796
Ensembl	ENSG00000179981	ENSMUSG00000046982
UniProt	Q6ZSZ6	Q5DTH5
RefSeq (мРНК)	NM_001308210 NM_005786	NM_001081300 NM_001364993 NM_001364994
RefSeq (білок)	NP_001295139 NP_005777 NP_005777.3	NP_001074769 NP_001351922 NP_001351923
Локус (UCSC)	Хр. 18: 75.21 – 75.29 Mb	Хр. 18: 84.03 – 84.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TSHZ1 (англ. Teashirt zinc finger homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 077 амінокислот, а молекулярна маса — 117 916.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRRKQQAPR		RSAAYVPEEE		LKAAEIDEEH		VEDDGLSLDI		QESEYMCNEE
TEIKEAQSYQ		NSPVSSATNQ		DAGYGSPFSE		SSDQLAHFKG		SSSREEKEDP
QCPDSVSYPQ		DSLAQIKAVY		ANLFSESCWS		SLALDLKKSG		STTSTNDASQ
KESSAPTPTP		PTCPVSTTGP		TTSTPSTSCS		SSTSHSSTTS		TSSSSGYDWH
QAALAKTLQQ		TSSYGLLPEP		SLFSTVQLYR		QNNKLYGSVF		TGASKFRCKD
CSAAYDTLVE		LTVHMNETGH		YRDDNRDKDS		EKTKRWSKPR		KRSLMEMEGK
EDAQKVLKCM		YCGHSFESLQ		DLSVHMIKTK		HYQKVPLKEP		VPAITKLVPS
TKKRALQDLA		PPCSPEPAGM		AAEVALSESA		KDQKAANPYV		TPNNRYGYQN
GASYTWQFEA		RKAQILKCME		CGSSHDTLQQ		LTAHMMVTGH		FLKVTTSASK
KGKQLVLDPV		VEEKIQSIPL		PPTTHTRLPA		SSIKKQPDSP		AGSTTSEEKK
EPEKEKPPVA		GDAEKIKEES		EDSLEKFEPS		TLYPYLREED		LDDSPKGGLD
ILKSLENTVS		TAISKAQNGA		PSWGGYPSIH		AAYQLPGTVK		PLPAAVQSVQ
VQPSYAGGVK		SLSSAEHNAL		LHSPGSLTPP		PHKSNVSAME		ELVEKVTGKV
NIKKEERPPE		KEKSSLAKAA		SPIAKENKDF		PKTEEVSGKP		QKKGPEAETG
KAKKEGPLDV		HTPNGTEPLK		AKVTNGCNNL		GIIMDHSPEP		SFINPLSALQ
SIMNTHLGKV		SKPVSPSLDP		LAMLYKISNS		MLDKPVYPAT		PVKQADAIDR
YYYENSDQPI		DLTKSKNKPL		VSSVADSVAS		PLRESALMDI		SDMVKNLTGR
LTPKSSTPST		VSEKSDADGS		SFEEALDELS		PVHKRKGRQS		NWNPQHLLIL
QAQFASSLRE		TTEGKYIMSD		LGPQERVHIS		KFTGLSMTTI		SHWLANVKYQ
LRRTGGTKFL		KNLDTGHPVF		FCNDCASQFR		TASTYISHLE		THLGFSLKDL
SKLPLNQIQE		QQNVSKVLTN		KTLGPLGATE		EDLGSTFQCK		LCNRTFASKH
AVKLHLSKTH		GKSPEDHLIY		VTELEKQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Див. також

• Хромосома 18