TBX2

TBX2
Ідентифікатори
Символи	TBX2, T-box 2, VETD, T-box transcription factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600747 MGI: 98494 HomoloGene: 38123 GeneCards: TBX2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • transcription regulator complex • клітинне ядро Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • roof of mouth development • atrioventricular canal development • pharynx development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of heart contraction • cardiac muscle tissue development • negative regulation of heart looping • mammary placode formation • embryonic digit morphogenesis • heart morphogenesis • outflow tract morphogenesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • aorta morphogenesis • transcription, DNA-templated • embryonic heart tube development • outflow tract septum morphogenesis • endocardial cushion morphogenesis • multicellular organism development • heart looping • muscle cell fate determination • клітинне старіння • developmental growth involved in morphogenesis • positive regulation of cardiac muscle cell proliferation • embryonic camera-type eye morphogenesis • positive regulation of cell population proliferation • negative regulation of cardiac chamber formation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6909	21385
Ensembl	ENSG00000121068	ENSMUSG00000000093
UniProt	Q13207	Q60707
RefSeq (мРНК)	NM_005994	NM_009324
RefSeq (білок)	NP_005985	NP_033350
Локус (UCSC)	Хр. 17: 61.4 – 61.41 Mb	Хр. 11: 85.72 – 85.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TBX2 (англ. T-box 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 712 амінокислот, а молекулярна маса — 75 066.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MREPALAASA		MAYHPFHAPR		PADFPMSAFL		AAAQPSFFPA		LALPPGALAK
PLPDPGLAGA		AAAAAAAAAA		AEAGLHVSAL		GPHPPAAHLR		SLKSLEPEDE
VEDDPKVTLE		AKELWDQFHK		LGTEMVITKS		GRRMFPPFKV		RVSGLDKKAK
YILLMDIVAA		DDCRYKFHNS		RWMVAGKADP		EMPKRMYIHP		DSPATGEQWM
AKPVAFHKLK		LTNNISDKHG		FTILNSMHKY		QPRFHIVRAN		DILKLPYSTF
RTYVFPETDF		IAVTAYQNDK		ITQLKIDNNP		FAKGFRDTGN		GRREKRKQLT
LPSLRLYEEH		CKPERDGAES		DASSCDPPPA		REPPTSPGAA		PSPLRLHRAR
AEEKSCAADS		DPEPERLSEE		RAGAPLGRSP		APDSASPTRL		TEPERARERR
SPERGKEPAE		SGGDGPFGLR		SLEKERAEAR		RKDEGRKEAA		EGKEQGLAPL
VVQTDSASPL		GAGHLPGLAF		SSHLHGQQFF		GPLGAGQPLF		LHPGQFTMGP
GAFSAMGMGH		LLASVAGGGN		GGGGGPGTAA		GLDAGGLGPA		ASAASTAAPF
PFHLSQHMLA		SQGIPMPTFG		GLFPYPYTYM		AAAAAAASAL		PATSAAAAAA
AAAGSLSRSP		FLGSARPRLR		FSPYQIPVTI		PPSTSLLTTG		LASEGSKAAG
GNSREPSPLP		ELALRKVGAP		SRGALSPSGS		AKEAANELQS		IQRLVSGLES
QRALSPGRES		PK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Campbell C., Goodrich K., Casey G., Beatty B. (1995). Cloning and mapping of a human gene (TBX2) sharing a highly conserved protein motif with the Drosophila omb gene. Genomics. 28: 255—260. PMID 8530034 DOI:10.1006/geno.1995.1139
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Law D.J., Gebuhr T., Garvey N., Agulnik S.I., Silver L.M. (1995). Identification, characterization, and localization to chromosome 17q21-22 of the human TBX2 homolog, member of a conserved developmental gene family. Mamm. Genome. 6: 793—797. PMID 8597636 DOI:10.1007/BF00539006

Див. також

• Хромосома 17