Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TBPL2
Ідентифікатори
Символи
TBPL2 , TBP2, TRF3, TATA-box binding protein like 2
Зовнішні ІД
OMIM : 608964 MGI: 2684058 HomoloGene: 133152 GeneCards: TBPL2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding
Клітинна компонента
• цитоплазма • клітинне ядро • transcription factor TFIIIB complex • transcription regulator complex • transcription factor TFIID complex
Біологічний процес
• multicellular organism development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • DNA-templated transcription, initiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1950094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase III preinitiation complex assembly
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 14: 55.41 – 55.46 Mb
Хр. 2: 23.96 – 23.99 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
TBPL2 (англ. TATA-box binding protein like 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 375 амінокислот , а молекулярна маса — 41 524[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MASAPWPERV PRLLAPRLPS YPPPPPTVGL RSMEQEETYL ELYLDQCAAQ
DGLAPPRSPL FSPVVPYDMY ILNASNPDTA FNSNPEVKET SGDFSSVDLS
FLPDEVTQEN KDQPVISKHE TEENSESQSP QSRLPSPSEQ DVGLGLNSSS
LSNSHSQLHP GDTDSVQPSP EKPNSDSLSL ASITPMTPMT PISECCGIVP
QLQNIVSTVN LACKLDLKKI ALHAKNAEYN PKRFAAVIMR IREPRTTALI
FSSGKMVCTG AKSEEQSRLA ARKYARVVQK LGFPARFLDF KIQNMVGSCD
VRFPIRLEGL VLTHQQFSSY EPELFPGLIY RMVKPRIVLL IFVSGKVVLT
GAKERSEIYE AFENIYPILK GFKKA
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші