Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
STAT6
Ідентифікатори
Символи
STAT6 , D12S1644, IL-4-STAT, STAT6B, STAT6C, signal transducer and activator of transcription 6
Зовнішні ІД
OMIM : 601512 MGI: 103034 HomoloGene: 2373 GeneCards: STAT6
Пов'язані генетичні захворювання
eosinophilic esophagitis [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• identical protein binding • sequence-specific DNA binding • protein phosphatase binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма • membrane raft • цитоплазма • гіалоплазма • ядерна мембрана
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1950094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • T-helper 1 cell lineage commitment • regulation of cell population proliferation • response to cytokine • interleukin-4-mediated signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to hydrogen peroxide • mammary gland epithelial cell proliferation • cellular response to reactive nitrogen species • positive regulation of type I interferon production • positive regulation of isotype switching to IgE isotypes • mammary gland morphogenesis • negative regulation of type 2 immune response • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway • positive regulation of cold-induced thermogenesis • defense response • receptor signaling pathway via JAK-STAT • response to peptide hormone • growth hormone receptor signaling pathway via JAK-STAT
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 57.1 – 57.13 Mb
Хр. 10: 127.48 – 127.5 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
STAT6 (англ. Signal transducer and activator of transcription 6 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 847 амінокислот , а молекулярна маса — 94 135[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSLWGLVSKM PPEKVQRLYV DFPQHLRHLL GDWLESQPWE FLVGSDAFCC
NLASALLSDT VQHLQASVGE QGEGSTILQH ISTLESIYQR DPLKLVATFR
QILQGEKKAV MEQFRHLPMP FHWKQEELKF KTGLRRLQHR VGEIHLLREA
LQKGAEAGQV SLHSLIETPA NGTGPSEALA MLLQETTGEL EAAKALVLKR
IQIWKRQQQL AGNGAPFEES LAPLQERCES LVDIYSQLQQ EVGAAGGELE
PKTRASLTGR LDEVLRTLVT SCFLVEKQPP QVLKTQTKFQ AGVRFLLGLR
FLGAPAKPPL VRADMVTEKQ ARELSVPQGP GAGAESTGEI INNTVPLENS
IPGNCCSALF KNLLLKKIKR CERKGTESVT EEKCAVLFSA SFTLGPGKLP
IQLQALSLPL VVIVHGNQDN NAKATILWDN AFSEMDRVPF VVAERVPWEK
MCETLNLKFM AEVGTNRGLL PEHFLFLAQK IFNDNSLSME AFQHRSVSWS
QFNKEILLGR GFTFWQWFDG VLDLTKRCLR SYWSDRLIIG FISKQYVTSL
LLNEPDGTFL LRFSDSEIGG ITIAHVIRGQ DGSPQIENIQ PFSAKDLSIR
SLGDRIRDLA QLKNLYPKKP KDEAFRSHYK PEQMGKDGRG YVPATIKMTV
ERDQPLPTPE LQMPTMVPSY DLGMAPDSSM SMQLGPDMVP QVYPPHSHSI
PPYQGLSPEE SVNVLSAFQE PHLQMPPSLG QMSLPFDQPH PQGLLPCQPQ
EHAVSSPDPL LCSDVTMVED SCLSQPVTAF PQGTWIGEDI FPPLLPPTEQ
DLTKLLLEGQ GESGGGSLGA QPLLQPSHYG QSGISMSHMD LRANPSW
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , ацетилювання , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Patel B.K., Keck C.L., O'Leary R.S., Popescu N.C., LaRochelle W.J. (1998). Localization of the human stat6 gene to chromosome 12q13.3-q14.1, a region implicated in multiple solid tumors. Genomics . 52 : 192—200. PMID 9782085 DOI :10.1006/geno.1998.5436
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Litterst C.M., Pfitzner E. (2002). An LXXLL motif in the transactivation domain of STAT6 mediates recruitment of NCoA-1/SRC-1. J. Biol. Chem . 277 : 36052—36060. PMID 12138096 DOI :10.1074/jbc.M203556200
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші