SREBF2

SREBF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UKL
Ідентифікатори
Символи	SREBF2, SREBP-2, SREBP2, bHLHd2, sterol regulatory element binding transcription factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600481 MGI: 107585 HomoloGene: 20966 GeneCards: SREBF2
Онтологія гена Молекулярна функція • C-8 sterol isomerase activity • DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • E-box binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • гіалоплазма • SREBP-SCAP-Insig complex • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • нуклеоплазма • мітохондрія • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • steroid metabolic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • lipid metabolism • positive regulation of cholesterol storage • cellular response to laminar fluid shear stress • cellular response to starvation • cholesterol metabolic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of autophagy of mitochondrion • negative regulation of cholesterol efflux • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cholesterol biosynthetic process • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6721	20788
Ensembl	ENSG00000198911	ENSMUSG00000022463
UniProt	Q12772	Q3U1N2
RefSeq (мРНК)	NM_004599	NM_033218
RefSeq (білок)	NP_004590	NP_150087
Локус (UCSC)	Хр. 22: 41.83 – 41.91 Mb	Хр. 15: 82.03 – 82.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SREBF2 (англ. Sterol regulatory element binding transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 141 амінокислот, а молекулярна маса — 123 688.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDDSGELGGL		ETMETLTELG		DELTLGDIDE		MLQFVSNQVG		EFPDLFSEQL
CSSFPGSGGS		GSSSGSSGSS		SSSSNGRGSS		SGAVDPSVQR		SFTQVTLPSF
SPSAASPQAP		TLQVKVSPTS		VPTTPRATPI		LQPRPQPQPQ		PQTQLQQQTV
MITPTFSTTP		QTRIIQQPLI		YQNAATSFQV		LQPQVQSLVT		SSQVQPVTIQ
QQVQTVQAQR		VLTQTANGTL		QTLAPATVQT		VAAPQVQQVP		VLVQPQIIKT
DSLVLTTLKT		DGSPVMAAVQ		NPALTALTTP		IQTAALQVPT		LVGSSGTILT
TMPVMMGQEK		VPIKQVPGGV		KQLEPPKEGE		RRTTHNIIEK		RYRSSINDKI
IELKDLVMGT		DAKMHKSGVL		RKAIDYIKYL		QQVNHKLRQE		NMVLKLANQK
NKLLKGIDLG		SLVDNEVDLK		IEDFNQNVLL		MSPPASDSGS		QAGFSPYSID
SEPGSPLLDD		AKVKDEPDSP		PVALGMVDRS		RILLCVLTFL		CLSFNPLTSL
LQWGGAHDSD		QHPHSGSGRS		VLSFESGSGG		WFDWMMPTLL		LWLVNGVIVL
SVFVKLLVHG		EPVIRPHSRS		SVTFWRHRKQ		ADLDLARGDF		AAAAGNLQTC
LAVLGRALPT		SRLDLACSLS		WNVIRYSLQK		LRLVRWLLKK		VFQCRRATPA
TEAGFEDEAK		TSARDAALAY		HRLHQLHITG		KLPAGSACSD		VHMALCAVNL
AECAEEKIPP		STLVEIHLTA		AMGLKTRCGG		KLGFLASYFL		SRAQSLCGPE
HSAVPDSLRW		LCHPLGQKFF		MERSWSVKSA		AKESLYCAQR		NPADPIAQVH
QAFCKNLLER		AIESLVKPQA		KKKAGDQEEE		SCEFSSALEY		LKLLHSFVDS
VGVMSPPLSR		SSVLKSALGP		DIICRWWTSA		ITVAISWLQG		DDAAVRSHFT
KVERIPKALE		VTESPLVKAI		FHACRAMHAS		LPGKADGQQS		SFCHCERASG
HLWSSLNVSG		ATSDPALNHV		VQLLTCDLLL		SLRTALWQKQ		ASASQAVGET
YHASGAELAG		FQRDLGSLRR		LAHSFRPAYR		KVFLHEATVR		LMAGASPTRT
HQLLEHSLRR		RTTQSTKHGE		VDAWPGQRER		ATAILLACRH		LPLSFLSSPG
QRAVLLAEAA		RTLEKVGDRR		SCNDCQQMIV		KLGGGTAIAA		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hua X., Sakai J., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Regulated cleavage of sterol regulatory element binding proteins requires sequences on both sides of the endoplasmic reticulum membrane. J. Biol. Chem. 271: 10379—10384. PMID 8626610 DOI:10.1074/jbc.271.17.10379
• Pai J.-T., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Purification and cDNA cloning of a second apoptosis-related cysteine protease that cleaves and activates sterol regulatory element binding proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 5437—5442. PMID 8643593 DOI:10.1073/pnas.93.11.5437
• Duncan E.A., Dave U.P., Sakai J., Goldstein J.L., Brown M.S. (1998). Second-site cleavage in sterol regulatory element-binding protein occurs at transmembrane junction as determined by cysteine panning. J. Biol. Chem. 273: 17801—17809. PMID 9651382 DOI:10.1074/jbc.273.28.17801
• Ye J., Dave U.P., Grishin N.V., Goldstein J.L., Brown M.S. (2000). Asparagine-proline sequence within membrane-spanning segment of SREBP triggers intramembrane cleavage by site-2 protease. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 5123—5128. PMID 10805775 DOI:10.1073/pnas.97.10.5123
• Irisawa M., Inoue J., Ozawa N., Mori K., Sato R. (2009). The sterol-sensing endoplasmic reticulum (ER) membrane protein TRC8 hampers ER to Golgi transport of sterol regulatory element-binding protein-2 (SREBP-2)/SREBP cleavage-activated protein and reduces SREBP-2 cleavage. J. Biol. Chem. 284: 28995—29004. PMID 19706601 DOI:10.1074/jbc.M109.041376

Див. також

• Хромосома 22