SPRTN

SPRTN
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5IY4
Ідентифікатори
Символи	SPRTN, C1orf124, DDDL1880, DVC1, PRO4323, Spartan, dJ876B10.3, SprT-like N-terminal domain
Зовнішні ІД	OMIM: 616086 MGI: 2685351 HomoloGene: 32764 GeneCards: SPRTN
Пов'язані генетичні захворювання
progeroid features-hepatocellular carcinoma predisposition syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма • хромосома Біологічний процес • error-free translesion synthesis • positive regulation of protein ubiquitination • response to UV • cellular response to DNA damage stimulus • translesion synthesis • GO:0100026 Репарація ДНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	83932	244666
Ensembl	ENSG00000010072	ENSMUSG00000031986
UniProt	Q9H040	G3X912
RefSeq (мРНК)	NM_001010984 NM_001261462 NM_032018	NM_001111141
RefSeq (білок)	NP_001010984 NP_001248391 NP_114407	NP_001104611
Локус (UCSC)	Хр. 1: 231.34 – 231.36 Mb	Хр. 8: 125.62 – 125.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPRTN (англ. SprT-like N-terminal domain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 489 амінокислот, а молекулярна маса — 55 134.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDDDLMLALR		LQEEWNLQEA		ERDHAQESLS		LVDASWELVD		PTPDLQALFV
QFNDQFFWGQ		LEAVEVKWSV		RMTLCAGICS		YEGKGGMCSI		RLSEPLLKLR
PRKDLVETLL		HEMIHAYLFV		TNNDKDREGH		GPEFCKHMHR		INSLTGANIT
VYHTFHDEVD		EYRRHWWRCN		GPCQHRPPYY		GYVKRATNRE		PSAHDYWWAE
HQKTCGGTYI		KIKEPENYSK		KGKGKAKLGK		EPVLAAENKD		KPNRGEAQLV
IPFSGKGYVL		GETSNLPSPG		KLITSHAINK		TQDLLNQNHS		ANAVRPNSKI
KVKFEQNGSS		KNSHLVSPAV		SNSHQNVLSN		YFPRVSFANQ		KAFRGVNGSP
RISVTVGNIP		KNSVSSSSQR		RVSSSKISLR		NSSKVTESAS		VMPSQDVSGS
EDTFPNKRPR		LEDKTVFDNF		FIKKEQIKSS		GNDPKYSTTT		AQNSSSSSSQ
SKMVNCPVCQ		NEVLESQINE		HLDWCLEGDS		IKVKSEESL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Machida Y., Kim M.S., Machida Y.J. (2012). Spartan/C1orf124 is important to prevent UV-induced mutagenesis. Cell Cycle. 11: 3395—3402. PMID 22894931 DOI:10.4161/cc.21694
• Ghosal G., Leung J.W., Nair B.C., Fong K.W., Chen J. (2012). Proliferating cell nuclear antigen (PCNA)-binding protein C1orf124 is a regulator of translesion synthesis. J. Biol. Chem. 287: 34225—34233. PMID 22902628 DOI:10.1074/jbc.M112.400135
• Centore R.C., Yazinski S.A., Tse A., Zou L. (2012). Spartan/C1orf124, a reader of PCNA ubiquitylation and a regulator of UV-induced DNA damage response. Mol. Cell. 46: 625—635. PMID 22681887 DOI:10.1016/j.molcel.2012.05.020

Див. також

• Хромосома 1