SKP1

SKP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1FQV, 1FS1, 1FS2, 1LDK, 1P22, 2ASS, 2AST, 2E31, 2E32, 2OVP, 2OVQ, 2OVR, 3L2O, 3WSO, 4I6J, 5IBK
Ідентифікатори
Символи	SKP1, EMC19, OCP-II, OCP2, SKP1A, TCEB1L, p19A, S-phase kinase-associated protein 1, S-phase kinase associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601434 MGI: 103575 HomoloGene: 38775 GeneCards: SKP1
Онтологія гена Молекулярна функція • cullin family protein binding • beta-catenin binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • protein domain specific binding Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • PcG protein complex • клітинне ядро • гіалоплазма • SCF ubiquitin ligase complex • Cul7-RING ubiquitin ligase complex • центросома Біологічний процес • ubiquitin-dependent protein catabolic process • histone H2A monoubiquitination • NIK/NF-kappaB signaling • G2/M transition of mitotic cell cycle • stress-activated MAPK cascade • Убіквітин-залежний протеоліз • protein polyubiquitination • Wnt signaling pathway • SCF complex assembly • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • maintenance of protein location in nucleus • cellular iron ion homeostasis • посттрансляційна модифікація • interleukin-1-mediated signaling pathway • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0022415 viral process • regulation of mitotic cell cycle phase transition • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • T cell receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6500	21402
Ensembl	ENSG00000113558	ENSMUSG00000036309
UniProt	P63208	Q9WTX5
RefSeq (мРНК)	NM_170679 NM_006930	NM_011543
RefSeq (білок)	NP_008861 NP_733779	NP_035673
Локус (UCSC)	Хр. 5: 134.15 – 134.18 Mb	Хр. 11: 52.12 – 52.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SKP1 (англ. S-phase kinase associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 163 амінокислот, а молекулярна маса — 18 658.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSIKLQSSD		GEIFEVDVEI		AKQSVTIKTM		LEDLGMDDEG		DDDPVPLPNV
NAAILKKVIQ		WCTHHKDDPP		PPEDDENKEK		RTDDIPVWDQ		EFLKVDQGTL
FELILAANYL		DIKGLLDVTC		KTVANMIKGK		TPEEIRKTFN		IKNDFTEEEE
AQVRKENQWC		EEK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг.

Література

• Zhang H., Kobayashi R., Galaktionov K., Beach D. (1995). p19Skp1 and p45Skp2 are essential elements of the cyclin A-CDK2 S phase kinase. Cell. 82: 915—925. PMID 7553852 DOI:10.1016/0092-8674(95)90271-6
• Sowden J., Morrison K., Schofield J., Putt W., Edwards Y. (1995). A novel cDNA with homology to an RNA polymerase II elongation factors maps to human chromosome 5q31 (TCEB1L) and to mouse chromosome 11 (Tceb1l). Genomics. 29: 145—151. PMID 8530064 DOI:10.1006/geno.1995.1225
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Liang Y., Chen H., Asher J.H. Jr., Chang C.-C., Friedman T.B. (1997). Human inner ear OCP2 cDNA maps to 5q22-5q35.2 with related sequences on chromosomes 4p16.2-4p14, 5p13-5q22, 7pter-q22, 10 and 12p13-12qter. Gene. 184: 163—167. PMID 9031623 DOI:10.1016/S0378-1119(96)00590-2
• Dias D.C., Dolios G., Wang R., Pan Z.Q. (2002). CUL7: a DOC domain-containing cullin selectively binds Skp1.Fbx29 to form an SCF-like complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 16601—16606. PMID 12481031 DOI:10.1073/pnas.252646399
• Matsuzawa S., Reed J.C. (2001). Siah-1, SIP, and Ebi collaborate in a novel pathway for beta-catenin degradation linked to p53 responses. Mol. Cell. 7: 915—926. PMID 11389839 DOI:10.1016/S1097-2765(01)00242-8

Див. також

• Хромосома 5