SCUBE3

SCUBE3
Ідентифікатори
Символи	SCUBE3, CEGF3, signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 3, SSFSC2
Зовнішні ІД	OMIM: 614708 MGI: 3045253 HomoloGene: 65059 GeneCards: SCUBE3
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • extracellular region • cell surface • міжклітинний простір • клітинна мембрана Біологічний процес • protein homooligomerization • protein heterooligomerization • GO:0072468 сигнальна трансдукція • диференціація клітин • positive regulation of smoothened signaling pathway • extracellular matrix disassembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	222663	268935
Ensembl	ENSG00000146197	ENSMUSG00000038677
UniProt	Q8IX30	Q66PY1
RefSeq (мРНК)	NM_001303136 NM_152753	NM_001004366 NM_001368734
RefSeq (білок)	NP_001290065 NP_689966	NP_001004366
Локус (UCSC)	Хр. 6: 35.21 – 35.25 Mb	Хр. 17: 28.36 – 28.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCUBE3 (англ. Signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 993 амінокислот, а молекулярна маса — 109 282.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSGRVPGLC		LLVLLVHARA		AQYSKAAQDV		DECVEGTDNC		HIDAICQNTP
RSYKCICKSG		YTGDGKHCKD		VDECEREDNA		GCVHDCVNIP		GNYRCTCYDG
FHLAHDGHNC		LDVDECAEGN		GGCQQSCVNM		MGSYECHCRE		GFFLSDNQHT
CIQRPEEGMN		CMNKNHGCAH		ICRETPKGGI		ACECRPGFEL		TKNQRDCKLT
CNYGNGGCQH		TCDDTEQGPR		CGCHIKFVLH		TDGKTCIETC		AVNNGGCDSK
CHDAATGVHC		TCPVGFMLQP		DRKTCKDIDE		CRLNNGGCDH		ICRNTVGSFE
CSCKKGYKLL		INERNCQDID		ECSFDRTCDH		ICVNTPGSFQ		CLCHRGYLLY
GITHCGDVDE		CSINRGGCRF		GCINTPGSYQ		CTCPAGQGRL		HWNGKDCTEP
LKCQGSPGAS		KAMLSCNRSG		KKDTCALTCP		SRARFLPESE		NGFTVSCGTP
SPRAAPARAG		HNGNSTNSNH		CHEAAVLSIK		QRASFKIKDA		KCRLHLRNKG
KTEEAGRITG		PGGAPCSECQ		VTFIHLKCDS		SRKGKGRRAR		TPPGKEVTRL
TLELEAEVRA		EETTASCGLP		CLRQRMERRL		KGSLKMLRKS		INQDRFLLRL
AGLDYELAHK		PGLVAGERAE		PMESCRPGQH		RAGTKCVSCP		QGTYYHGQTE
QCVPCPAGTF		QEREGQLSCD		LCPGSDAHGP		LGATNVTTCA		GQCPPGQHSV
DGFKPCQPCP		RGTYQPEAGR		TLCFPCGGGL		TTKHEGAISF		QDCDTKVQCS
PGHYYNTSIH		RCIRCAMGSY		QPDFRQNFCS		RCPGNTSTDF		DGSTSVAQCK
NRQCGGELGE		FTGYIESPNY		PGNYPAGVEC		IWNINPPPKR		KILIVVPEIF
LPSEDECGDV		LVMRKNSSPS		SITTYETCQT		YERPIAFTAR		SRKLWINFKT
SEANSARGFQ		IPYVTYDEDY		EQLVEDIVRD		GRLYASENHQ		EILKDKKLIK
AFFEVLAHPQ		NYFKYTEKHK		EMLPKSFIKL		LRSKVSSFLR		PYK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6