RTL3

RTL3
Ідентифікатори
Символи	RTL3, Mar3, Mart3, ZHC5, ZCCHC5, zinc finger CCHC-type containing 5, SIRH9, retrotransposon Gag like 3
Зовнішні ІД	MGI: 2685221 HomoloGene: 19397 GeneCards: RTL3
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	203430	213436
Ensembl	ENSG00000179300	ENSMUSG00000047686
UniProt	Q8N8U3	Q6P1Y1
RefSeq (мРНК)	NM_152694	NM_199468
RefSeq (білок)	NP_689907	NP_955762
Локус (UCSC)	Хр. X: 78.66 – 78.66 Mb	Хр. X: 105.88 – 105.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RTL3 (англ. Retrotransposon Gag like 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі X-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 475 амінокислот, а молекулярна маса — 52 817.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVEDLAASYI		VLKLENEIRQ		AQVQWLMEEN		AALQAQIPEL		QKSQAAKEYD
LLRKSSEAKE		PQKLPEHMNP		PAAWEAQKTP		EFKEPQKPPE		PQDLLPWEPP
AAWELQEAPA		APESLAPPAT		RESQKPPMAH		EIPTVLEGQG		PANTQDATIA
QEPKNSEPQD		PPNIEKPQEA		PEYQETAAQL		EFLELPPPQE		PLEPSNAQEF
LELSAAQESL		EGLIVVETSA		ASEFPQAPIG		LEATDFPLQY		TLTFSGDSQK
LPEFLVQLYS		YMRVRGHLYP		TEAALVSFVG		NCFSGRAGWW		FQLLLDIQSP
LLEQCESFIP		VLQDTFDNPE		NMKDANQCIH		QLCQGEGHVA		THFHLIAQEL
NWDESTLWIQ		FQEGLASSIQ		DELSHTSPAT		NLSDLITQCI		SLEEKPDPNP
LGKSSSAEGD		GPESPPAENQ		PMQAAINCPH		ISEAEWVRWH		KGRLCLYCGY
PGHFARDCPV		KPHQALQAGN		IQACQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Brandt J., Veith A.-M., Volff J.-N. (2005). A family of neofunctionalized Ty3/gypsy retrotransposon genes in mammalian genomes. Cytogenet. Genome Res. 110: 307—317. PMID 16093683 DOI:10.1159/000084963

Див. також

• Хромосома X