RPS21

RPS21
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 5FLX, 3J7R, 4D61, 4D5L, 4UJD, 3J7P, 4UJE, 4UJC
Ідентифікатори
Символи	RPS21, HLDF, S21, ribosomal protein S21
Зовнішні ІД	OMIM: 180477 MGI: 1913731 HomoloGene: 90915 GeneCards: RPS21
Онтологія гена Молекулярна функція • protein N-terminus binding • structural constituent of ribosome • RNA binding Клітинна компонента • small ribosomal subunit • внутрішньоклітинний • гіалоплазма • cytosolic small ribosomal subunit • рибосома • нуклеоплазма • цитоплазма • ендоплазматичний ретикулум • rough endoplasmic reticulum • polysomal ribosome • синапс Біологічний процес • endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • translational initiation • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • viral transcription • Біосинтез білків • rRNA processing • cytoplasmic translation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6227	66481
Ensembl	ENSG00000171858	ENSMUSG00000039001
UniProt	P63220	Q9CQR2
RefSeq (мРНК)	NM_001024	NM_025587
RefSeq (білок)	NP_001015	NP_079863 NP_001342445 NP_001342446 NP_001342447 NP_001342449 NP_001342450
Локус (UCSC)	Хр. 20: 62.39 – 62.39 Mb	Хр. 2: 180.26 – 180.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RPS21 (англ. Ribosomal protein S21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 83 амінокислот, а молекулярна маса — 9 111.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQNDAGEFVD		LYVPRKCSAS		NRIIGAKDHA		SIQMNVAEVD		KVTGRFNGQF
KTYAICGAIR		RMGESDDSIL		RLAKADGIVS		KNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання.

Література

• Bhat K.S., Morrison S.G. (1993). Primary structure of human ribosomal protein S21. Nucleic Acids Res. 21: 2939—2939. PMID 8332502 DOI:10.1093/nar/21.12.2939
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Smirnova E.V., Rakitina T.V., Evtodienko A.Y., Kostanian I.A., Lipkin V.M. (2000). Cloning and characterization of the human ribosomal protein S21 gene. Bioorg. Khim. 26: 392—396. PMID 10900511

Див. також

• Хромосома 20