RNGTT

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
RNGTT
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи RNGTT, CAP1A, HCE, HCE1, hCAP, RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase
Зовнішні ІД OMIM: 603512 MGI: 1329041 HomoloGene: 37851 GeneCards: RNGTT
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001286426
NM_001286428
NM_003800
NM_011884
NM_001305273
RefSeq (білок)
NP_001273355
NP_001273357
NP_003791
NP_001292202
NP_036014
Локус (UCSC) Хр. 6: 88.61 – 88.96 Mb Хр. 4: 33.31 – 33.5 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RNGTT (англ. RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 597 амінокислот, а молекулярна маса — 68 557[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAHNKIPPRWLNCPRRGQPVAGRFLPLKTMLGPRYDSQVAEENRFHPSML
SNYLKSLKVKMGLLVDLTNTSRFYDRNDIEKEGIKYIKLQCKGHGECPTT
ENTETFIRLCERFNERNPPELIGVHCTHGFNRTGFLICAFLVEKMDWSIE
AAVATFAQARPPGIYKGDYLKELFRRYGDIEEAPPPPLLPDWCFEDDEDE
DEDEDGKKESEPGSSASFGKRRKERLKLGAIFLEGVTVKGVTQVTTQPKL
GEVQQKCHQFCGWEGSGFPGAQPVSMDKQNIKLLDLKPYKVSWKADGTRY
MMLIDGTNEVFMIDRDNSVFHVSNLEFPFRKDLRMHLSNTLLDGEMIIDR
VNGQAVPRYLIYDIIKFNSQPVGDCDFNVRLQCIEREIISPRHEKMKTGL
IDKTQEPFSVRNKPFFDICTSRKLLEGNFAKEVSHEMDGLIFQPTGKYKP
GRCDDILKWKPPSLNSVDFRLKITRMGGEGLLPQNVGLLYVGGYERPFAQ
IKVTKELKQYDNKIIECKFENNSWVFMRQRTDKSFPNAYNTAMAVCNSIS
NPVTKEMLFEFIDRCTAASQGQKRKHHLDPDTELMPPPPPKRPRPLT

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Yamada-Okabe T., Doi R., Shimmi O., Arisawa M., Yamada-Okabe H. (1998). Isolation and characterization of a human cDNA for mRNA 5'-capping enzyme. Nucleic Acids Res. 26: 1700—1706. PMID 9512541 DOI:10.1093/nar/26.7.1700
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Pillutla R.C., Yue Z., Maldonado E., Shatkin A.J. (1998). Recombinant human mRNA cap methyltransferase binds capping enzyme/RNA polymerase IIo complexes. J. Biol. Chem. 273: 21443—21446. PMID 9705270 DOI:10.1074/jbc.273.34.21443
  • Wen Y., Shatkin A.J. (1999). Transcription elongation factor hSPT5 stimulates mRNA capping. Genes Dev. 13: 1774—1779. PMID 10421630 DOI:10.1101/gad.13.14.1774
  • Chiu Y.-L., Coronel E., Ho C.K., Shuman S., Rana T.M. (2001). HIV-1 Tat protein interacts with mammalian capping enzyme and stimulates capping of TAR RNA. J. Biol. Chem. 276: 12959—12966. PMID 11278368 DOI:10.1074/jbc.M007901200

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10073 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
  4. UniProt, O60942 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]