Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
PHF3 (англ. PHD finger protein 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 039 амінокислот , а молекулярна маса — 229 481[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDIVDTFNHL IPTEHLDDAL FLGSNLENEV CEDFSASQNV LEDSLKNMLS
DKDPMLGSAS NQFCLPVLDS NDPNFQMPCS TVVGLDDIMD EGVVKESGND
TIDEEELILP NRNLRDKVEE NSVRSPRKSP RLMAQEQVRS LRQSTIAKRS
NAAPLSNTKK ASGKTVSTAK AGVKQPERSQ VKEEVCMSLK PEYHKENRRC
SRNSGQIEVV PEVSVSSSHS SVSSCLEMKD EDGLDSKHKC NNPGEIDVPS
HELNCSLLSE TCVTIGEKKN EALMECKAKP VGSPLFKFSD KEEHEQNDSI
SGKTGETVVE EMIATRKVEQ DSKETVKLSH EDDHILEDAG SSDISSDAAC
TNPNKTENSL VGLPSCVDEV TECNLELKDT MGIADKTENT LERNKIEPLG
YCEDAESNRQ LESTEFNKSN LEVVDTSTFG PESNILENAI CDVPDQNSKQ
LNAIESTKIE SHETANLQDD RNSQSSSVSY LESKSVKSKH TKPVIHSKQN
MTTDAPKKIV AAKYEVIHSK TKVNVKSVKR NTDVPESQQN FHRPVKVRKK
QIDKEPKIQS CNSGVKSVKN QAHSVLKKTL QDQTLVQIFK PLTHSLSDKS
HAHPGCLKEP HHPAQTGHVS HSSQKQCHKP QQQAPAMKTN SHVKEELEHP
GVEHFKEEDK LKLKKPEKNL QPRQRRSSKS FSLDEPPLFI PDNIATIRRE
GSDHSSSFES KYMWTPSKQC GFCKKPHGNR FMVGCGRCDD WFHGDCVGLS
LSQAQQMGEE DKEYVCVKCC AEEDKKTEIL DPDTLENQAT VEFHSGDKTM
ECEKLGLSKH TTNDRTKYID DTVKHKVKIL KRESGEGRNS SDCRDNEIKK
WQLAPLRKMG QPVLPRRSSE EKSEKIPKES TTVTCTGEKA SKPGTHEKQE
MKKKKVEKGV LNVHPAASAS KPSADQIRQS VRHSLKDILM KRLTDSNLKV
PEEKAAKVAT KIEKELFSFF RDTDAKYKNK YRSLMFNLKD PKNNILFKKV
LKGEVTPDHL IRMSPEELAS KELAAWRRRE NRHTIEMIEK EQREVERRPI
TKITHKGEIE IESDAPMKEQ EAAMEIQEPA ANKSLEKPEG SEKQKEEVDS
MSKDTTSQHR QHLFDLNCKI CIGRMAPPVD DLSPKKVKVV VGVARKHSDN
EAESIADALS STSNILASEF FEEEKQESPK STFSPAPRPE MPGTVEVEST
FLARLNFIWK GFINMPSVAK FVTKAYPVSG SPEYLTEDLP DSIQVGGRIS
PQTVWDYVEK IKASGTKEIC VVRFTPVTEE DQISYTLLFA YFSSRKRYGV
AANNMKQVKD MYLIPLGATD KIPHPLVPFD GPGLELHRPN LLLGLIIRQK
LKRQHSACAS TSHIAETPES APPIALPPDK KSKIEVSTEE APEEENDFFN
SFTTVLHKQR NKPQQNLQED LPTAVEPLME VTKQEPPKPL RFLPGVLIGW
ENQPTTLELA NKPLPVDDIL QSLLGTTGQV YDQAQSVMEQ NTVKEIPFLN
EQTNSKIEKT DNVEVTDGEN KEIKVKVDNI SESTDKSAEI ETSVVGSSSI
SAGSLTSLSL RGKPPDVSTE AFLTNLSIQS KQEETVESKE KTLKRQLQED
QENNLQDNQT SNSSPCRSNV GKGNIDGNVS CSENLVANTA RSPQFINLKR
DPRQAAGRSQ PVTTSESKDG DSCRNGEKHM LPGLSHNKEH LTEQINVEEK
LCSAEKNSCV QQSDNLKVAQ NSPSVENIQT SQAEQAKPLQ EDILMQNIET
VHPFRRGSAV ATSHFEVGNT CPSEFPSKSI TFTSRSTSPR TSTNFSPMRP
QQPNLQHLKS SPPGFPFPGP PNFPPQSMFG FPPHLPPPLL PPPGFGFAQN
PMVPWPPVVH LPGQPQRMMG PLSQASRYIG PQNFYQVKDI RRPERRHSDP
WGRQDQQQLD RPFNRGKGDR QRFYSDSHHL KRERHEKEWE QESERHRRRD
RSQDKDRDRK SREEGHKDKE RARLSHGDRG TDGKASRDSR NVDKKPDKPK
SEDYEKDKER EKSKHREGEK DRDRYHKDRD HTDRTKSKR
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші