OPN3

OPN3
Ідентифікатори
Символи	OPN3, ECPN, PPP1R116, opsin 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606695 MGI: 1338022 HomoloGene: 40707 GeneCards: OPN3
Онтологія гена Молекулярна функція • G protein-coupled receptor activity • photoreceptor activity • signal transducer activity • G protein-coupled photoreceptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • photoreceptor outer segment Біологічний процес • G protein-coupled receptor signaling pathway • regulation of circadian rhythm • GO:0072468 сигнальна трансдукція • відповідь на стимул • detection of light stimulus • detection of visible light • phototransduction • cellular response to light stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23596	13603
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000026525
UniProt	Q9H1Y3	Q9WUK7
RefSeq (мРНК)	NM_014322 NM_001030011 NM_001030012 NM_001381855 NM_001381856	NM_010098
RefSeq (білок)	NP_055137 NP_001368784 NP_001368785	NP_034228
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 1: 175.49 – 175.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OPN3 (англ. Opsin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 402 амінокислот, а молекулярна маса — 44 873.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYSGNRSGGH		GYWDGGGAAG		AEGPAPAGTL		SPAPLFSPGT		YERLALLLGS
IGLLGVGNNL		LVLVLYYKFQ		RLRTPTHLLL		VNISLSDLLV		SLFGVTFTFV
SCLRNGWVWD		TVGCVWDGFS		GSLFGIVSIA		TLTVLAYERY		IRVVHARVIN
FSWAWRAITY		IWLYSLAWAG		APLLGWNRYI		LDVHGLGCTV		DWKSKDANDS
SFVLFLFLGC		LVVPLGVIAH		CYGHILYSIR		MLRCVEDLQT		IQVIKILKYE
KKLAKMCFLM		IFTFLVCWMP		YIVICFLVVN		GHGHLVTPTI		SIVSYLFAKS
NTVYNPVIYV		FMIRKFRRSL		LQLLCLRLLR		CQRPAKDLPA		AGSEMQIRPI
VMSQKDGDRP		KKKVTFNSSS		IIFIITSDES		LSVDDSDKTN		GSKVDVIQVR
PL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Blackshaw S., Snyder S.H. (1999). Encephalopsin: a novel mammalian extraretinal opsin discretely localized in the brain. J. Neurosci. 19: 3681—3690. PMID 10234000

Див. також

• Хромосома 1