NUP35

NUP35
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4LIR
Ідентифікатори
Символи	NUP35, MP-44, MP44, NP44, NUP53, nucleoporin 35kDa, nucleoporin 35
Зовнішні ІД	OMIM: 608140 MGI: 1916732 HomoloGene: 44517 GeneCards: NUP35
Онтологія гена Молекулярна функція • single-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phospholipid binding • nucleic acid binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore Клітинна компонента • Ядерна пластинка • ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • клітинна мембрана • ядерна пора • нуклеоплазма • nuclear pore central transport channel • nuclear pore nuclear basket • клітинне ядро • host cell Біологічний процес • mRNA transport • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • protein transport • GO:0022415 viral process • nuclear pore organization • NLS-bearing protein import into nucleus • mRNA export from nucleus • nucleocytoplasmic transport • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	129401	69482
Ensembl	ENSG00000163002	ENSMUSG00000026999
UniProt	Q8NFH5	Q8R4R6
RefSeq (мРНК)	NM_001008544 NM_001287584 NM_001287585 NM_138285	NM_001190179 NM_027091
RefSeq (білок)	NP_001274513 NP_001274514 NP_612142	NP_001177108 NP_081367
Локус (UCSC)	Хр. 2: 183.12 – 183.16 Mb	Хр. 2: 80.45 – 80.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUP35 (англ. Nucleoporin 35) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 326 амінокислот, а молекулярна маса — 34 774.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAFAVEPQG		PALGSEPMML		GSPTSPKPGV		NAQFLPGFLM		GDLPAPVTPQ
PRSISGPSVG		VMEMRSPLLA		GGSPPQPVVP		AHKDKSGAPP		VRSIYDDISS
PGLGSTPLTS		RRQPNISVMQ		SPLVGVTSTP		GTGQSMFSPA		SIGQPRKTTL
SPAQLDPFYT		QGDSLTSEDH		LDDSWVTVFG		FPQASASYIL		LQFAQYGNIL
KHVMSNTGNW		MHIRYQSKLQ		ARKALSKDGR		IFGESIMIGV		KPCIDKSVME
SSDRCALSSP		SLAFTPPIKT		LGTPTQPGST		PRISTMRPLA		TAYKASTSDY
QVISDRQTPK		KDESLVSKAM		EYMFGW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

• Cronshaw J.M., Krutchinsky A.N., Zhang W., Chait B.T., Matunis M.J. (2002). Proteomic analysis of the mammalian nuclear pore complex. J. Cell Biol. 158: 915—927. PMID 12196509 DOI:10.1083/jcb.200206106
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hawryluk-Gara L.A., Shibuya E.K., Wozniak R.W. (2005). Vertebrate Nup53 interacts with the nuclear lamina and is required for the assembly of a Nup93-containing complex. Mol. Biol. Cell. 16: 2382—2394. PMID 15703211 DOI:10.1091/mbc.E04-10-0857

Див. також

• Хромосома 2