NLRP2

NLRP2
Ідентифікатори
Символи	NLRP2, CLR19.9, NALP2, NBS1, PAN1, PYPAF2, NLR family, pyrin domain containing 2, NLR family pyrin domain containing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 609364 MGI: 3041206 HomoloGene: 56789 GeneCards: NLRP2
Онтологія гена Молекулярна функція • Pyrin domain binding • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding Клітинна компонента • цитоплазма • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • inflammatory response • вроджений імунітет • процес імунної системи • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55655	232827
Ensembl	ENSG00000278789 ENSG00000275796 ENSG00000277060 ENSG00000275843 ENSG00000275399 ENSG00000022556 ENSG00000275082 ENSG00000278682 ENSG00000274638 ENSG00000273992	ENSMUSG00000035177
UniProt	Q9NX02	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_017852 NM_001174081 NM_001174082 NM_001174083 NM_001348003	NM_177690
RefSeq (білок)	NP_001167552 NP_001167553 NP_001167554 NP_060322 NP_001334932	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 19: 54.95 – 55 Mb	Хр. 7: 5.3 – 5.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NLRP2 (англ. NLR family pyrin domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 062 амінокислот, а молекулярна маса — 120 515.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVSSAQMGFN		LQALLEQLSQ		DELSKFKYLI		TTFSLAHELQ		KIPHKEVDKA
DGKQLVEILT		THCDSYWVEM		ASLQVFEKMH		RMDLSERAKD		EVREAALKSF
NKRKPLSLGI		TRKERPPLDV		DEMLERFKTE		AQAFTETKGN		VICLGKEVFK
GKKPDKDNRC		RYILKTKFRE		MWKSWPGDSK		EVQVMAERYK		MLIPFSNPRV
LPGPFSYTVV		LYGPAGLGKT		TLAQKLMLDW		AEDNLIHKFK		YAFYLSCREL
SRLGPCSFAE		LVFRDWPELQ		DDIPHILAQA		RKILFVIDGF		DELGAAPGAL
IEDICGDWEK		KKPVPVLLGS		LLNRVMLPKA		ALLVTTRPRA		LRDLRILAEE
PIYIRVEGFL		EEDRRAYFLR		HFGDEDQAMR		AFELMRSNAA		LFQLGSAPAV
CWIVCTTLKL		QMEKGEDPVP		TCLTRTGLFL		RFLCSRFPQG		AQLRGALRTL
SLLAAQGLWA		QTSVLHREDL		ERLGVQESDL		RLFLDGDILR		QDRVSKGCYS
FIHLSFQQFL		TALFYTLEKE		EEEDRDGHTW		DIGDVQKLLS		GVERLRNPDL
IQAGYYSFGL		ANEKRAKELE		ATFGCRMSPD		IKQELLRCDI		SCKGGHSTVT
DLQELLGCLY		ESQEEELVKE		VMAQFKEISL		HLNAVDVVPS		SFCVKHCRNL
QKMSLQVIKE		NLPENVTASE		SDAEVERSQD		DQHMLPFWTD		LCSIFGSNKD
LMGLAINDSF		LSASLVRILC		EQIASDTCHL		QRVVFKNISP		ADAHRNLCLA
LRGHKTVTYL		TLQGNDQDDM		FPALCEVLRH		PECNLRYLGL		VSCSATTQQW
ADLSLALEVN		QSLTCVNLSD		NELLDEGAKL		LYTTLRHPKC		FLQRLSLENC
HLTEANCKDL		AAVLVVSREL		THLCLAKNPI		GNTGVKFLCE		GLRYPECKLQ
TLVLWNCDIT		SDGCCDLTKL		LQEKSSLLCL		DLGLNHIGVK		GMKFLCEALR
KPLCNLRCLW		LWGCSIPPFS		CEDLCSALSC		NQSLVTLDLG		QNPLGSSGVK
MLFETLTCSS		GTLRTLRLKI		DDFNDELNKL		LEEIEEKNPQ		LIIDTEKHHP
WAERPSSHDF		MI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Bertin J., DiStefano P.S. (2000). The PYRIN domain: a novel motif found in apoptosis and inflammation proteins. Cell Death Differ. 7: 1273—1274. PMID 11270363 DOI:10.1038/sj.cdd.4400774
• Martinon F., Hofmann K., Tschopp J. (2001). The pyrin domain: a possible member of the death domain-fold family implicated in apoptosis and inflammation. Curr. Biol. 11: R118—R120. PMID 11250163 DOI:10.1016/S0960-9822(01)00056-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19