NLRC5

NLRC5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MJM
Ідентифікатори
Символи	NLRC5, CLR16.1, NOD27, NOD4, NLR family, CARD domain containing 5, NLR family CARD domain containing 5
Зовнішні ІД	OMIM: 613537 MGI: 3612191 HomoloGene: 88935 GeneCards: NLRC5
Пов'язані генетичні захворювання
шизофренія, біполярний афективний розлад
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • центросома • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • negative regulation of type I interferon production • positive regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of MHC class I biosynthetic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of kinase activity • процес імунної системи • вроджений імунітет • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • response to bacterium • GO:0007243 intracellular signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84166	434341
Ensembl	ENSG00000140853	ENSMUSG00000074151
UniProt	Q86WI3	C3VPR6
RefSeq (мРНК)	NM_032206 NM_001330552	NM_001033207
RefSeq (білок)	NP_001317481 NP_115582	NP_001028379
Локус (UCSC)	Хр. 16: 56.99 – 57.08 Mb	Хр. 8: 95.16 – 95.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NLRC5 (англ. NLR family CARD domain containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 866 амінокислот, а молекулярна маса — 204 595.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPVGLQLGN		KNLWSCLVRL		LTKDPEWLNA		KMKFFLPNTD		LDSRNETLDP
EQRVILQLNK		LHVQGSDTWQ		SFIHCVCMQL		EVPLDLEVLL		LSTFGYDDGF
TSQLGAEGKS		QPESQLHHGL		KRPHQSCGSS		PRRKQCKKQQ		LELAKKYLQL
LRTSAQQRYR		SQIPGSGQPH		AFHQVYVPPI		LRRATASLDT		PEGAIMGDVK
VEDGADVSIS		DLFNTRVNKG		PRVTVLLGKA		GMGKTTLAHR		LCQKWAEGHL
NCFQALFLFE		FRQLNLITRF		LTPSELLFDL		YLSPESDHDT		VFQYLEKNAD
QVLLIFDGLD		EALQPMGPDG		PGPVLTLFSH		LCNGTLLPGC		RVMATSRPGK
LPACLPAEAA		MVHMLGFDGP		RVEEYVNHFF		SAQPSREGAL		VELQTNGRLR
SLCAVPALCQ		VACLCLHHLL		PDHAPGQSVA		LLPNMTQLYM		QMVLALSPPG
HLPTSSLLDL		GEVALRGLET		GKVIFYAKDI		APPLIAFGAT		HSLLTSFCVC
TGPGHQQTGY		AFTHLSLQEF		LAALHLMASP		KVNKDTLTQY		VTLHSRWVQR
TKARLGLSDH		LPTFLAGLAS		CTCRPFLSHL		AQGNEDCVGA		KQAAVVQVLK
KLATRKLTGP		KVVELCHCVD		ETQEPELASL		TAQSLPYQLP		FHNFPLTCTD
LATLTNILEH		REAPIHLDFD		GCPLEPHCPE		ALVGCGQIEN		LSFKSRKCGD
AFAEALSRSL		PTMGRLQMLG		LAGSKITARG		ISHLVKALPL		CPQLKEVSFR
DNQLSDQVVL		NIVEVLPHLP		RLRKLDLSSN		SICVSTLLCL		ARVAVTCPTV
RMLQAREADL		IFLLSPPTET		TAELQRAPDL		QESDGQRKGA		QSRSLTLRLQ
KCQLQVHDAE		ALIALLQEGP		HLEEVDLSGN		QLEDEGCRLM		AEAASQLHIA
RKLDLSNNGL		SVAGVHCVLR		AVSACWTLAE		LHISLQHKTV		IFMFAQEPEE
QKGPQERAAF		LDSLMLQMPS		ELPLSSRRMR		LTHCGLQEKH		LEQLCKALGG
SCHLGHLHLD		FSGNALGDEG		AARLAQLLPG		LGALQSLNLS		ENGLSLDAVL
GLVRCFSTLQ		WLFRLDISFE		SQHILLRGDK		TSRDMWATGS		LPDFPAAAKF
LGFRQRCIPR		SLCLSECPLE		PPSLTRLCAT		LKDCPGPLEL		QLSCEFLSDQ
SLETLLDCLP		QLPQLSLLQL		SQTGLSPKSP		FLLANTLSLC		PRVKKVDLRS
LHHATLHFRS		NEEEEGVCCG		RFTGCSLSQE		HVESLCWLLS		KCKDLSQVDL
SANLLGDSGL		RCLLECLPQV		PISGLLDLSH		NSISQESALY		LLETLPSCPR
VREASVNLGS		EQSFRIHFSR		EDQAGKTLRL		SECSFRPEHV		SRLATGLSKS
LQLTELTLTQ		CCLGQKQLAI		LLSLVGRPAG		LFSLRVQEPW		ADRARVLSLL
EVCAQASGSV		TEISISETQQ		QLCVQLEFPR		QEENPEAVAL		RLAHCDLGAH
HSLLVGQLME		TCARLQQLSL		SQVNLCEDDD		ASSLLLQSLL		LSLSELKTFR
LTSSCVSTEG		LAHLASGLGH		CHHLEELDLS		NNQFDEEGTK		ALMRALEGKW
MLKRLDLSHL		LLNSSTLALL		THRLSQMTCL		QSLRLNRNSI		GDVGCCHLSE
ALRAATSLEE		LDLSHNQIGD		AGVQHLATIL		PGLPELRKID		LSGNSISSAG
GVQLAESLVL		CRRLEELMLG		CNALGDPTAL		GLAQELPQHL		RVLHLPFSHL
GPGGALSLAQ		ALDGSPHLEE		ISLAENNLAG		GVLRFCMELP		LLRQIDLVSC
KIDNQTAKLL		TSSFTSCPAL		EVILLSWNLL		GDEAAAELAQ		VLPQMGRLKR
VDLEKNQITA		LGAWLLAEGL		AQGSSIQVIR		LWNNPIPCDM		AQHLKSQEPR
LDFAFFDNQP		QAPWGT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ting J.P.-Y., Davis B.K. (2005). CATERPILLER: a novel gene family important in immunity, cell death, and diseases. Annu. Rev. Immunol. 23: 387—414. PMID 15771576 DOI:10.1146/annurev.immunol.23.021704.115616

Див. також

• Хромосома 16