Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NFIB
Ідентифікатори
Символи
NFIB , CTF, HMGIC/NF-I/B, NF1-B, NFI-B, NFI-RED, NFIB2, NFIB3, nuclear factor I B, MACID
Зовнішні ІД
OMIM : 600728 MGI: 103188 HomoloGene: 4087 GeneCards: NFIB
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • double-stranded DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• внутрішньоклітинний • cerebellar mossy fiber • клітинне ядро • fibrillar center
Біологічний процес
• cell differentiation involved in salivary gland development • club cell differentiation • negative regulation of epithelial cell proliferation involved in lung morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of mesenchymal cell proliferation involved in lung development • chondrocyte differentiation • lung development • negative regulation of DNA binding • salivary gland cavitation • hindbrain development • glial cell differentiation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • commissural neuron axon guidance • transcription, DNA-templated • anterior commissure morphogenesis • lung ciliated cell differentiation • реплікація ДНК • type I pneumocyte differentiation • principal sensory nucleus of trigeminal nerve development • forebrain development • type II pneumocyte differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • transcription by RNA polymerase II • response to bacterium
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 9: 14.08 – 14.4 Mb
Хр. 4: 82.21 – 82.62 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NFIB (англ. Nuclear factor I B ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 420 амінокислот , а молекулярна маса — 47 442[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MMYSPICLTQ DEFHPFIEAL LPHVRAIAYT WFNLQARKRK YFKKHEKRMS
KDEERAVKDE LLSEKPEIKQ KWASRLLAKL RKDIRQEYRE DFVLTVTGKK
HPCCVLSNPD QKGKIRRIDC LRQADKVWRL DLVMVILFKG IPLESTDGER
LMKSPHCTNP ALCVQPHHIT VSVKELDLFL AYYVQEQDSG QSGSPSHNDP
AKNPPGYLED SFVKSGVFNV SELVRVSRTP ITQGTGVNFP IGEIPSQPYY
HDMNSGVNLQ RSLSSPPSSK RPKTISIDEN MEPSPTGDFY PSPSSPAAGS
RTWHERDQDM SSPTTMKKPE KPLFSSASPQ DSSPRLSTFP QHHHPGIPGV
AHSVISTRTP PPPSPLPFPT QAILPPAPSS YFSHPTIRYP PHLNPQDTLK
NYVPSYDPSS PQTSQSWYLG
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , реплікація ДНК , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Liu Y., Bernard H.U., Apt D. (1997). NFI-B3, a novel transcriptional repressor of the nuclear factor I family, is generated by alternative RNA processing. J. Biol. Chem . 272 : 10739—10745. PMID 9099724 DOI :10.1074/jbc.272.16.10739
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Qian F., Kruse U., Lichter P., Sippel A.E. (1995). Chromosomal localization of the four genes (NFIA, B, C, and X) for the human transcription factor nuclear factor I by FISH. Genomics . 28 : 66—73. PMID 7590749 DOI :10.1006/geno.1995.1107
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші