MYO18A

MYO18A
Ідентифікатори
Символи	MYO18A, MYSPDZ, SPR210, myosin XVIIIA, MAJN, SP-R210
Зовнішні ІД	OMIM: 610067 MGI: 2667185 HomoloGene: 7977 GeneCards: MYO18A
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • ADP binding • actin filament binding • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • trans-Golgi network • actomyosin • цитоскелет • myosin complex • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • cell surface Біологічний процес • Golgi organization • Golgi vesicle budding • actomyosin structure organization • DNA metabolic process • asymmetric Golgi ribbon formation • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of protein secretion • cell migration • Golgi ribbon formation • regulation of macrophage activation • positive regulation of opsonization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	399687	360013
Ensembl	ENSG00000196535	ENSMUSG00000000631
UniProt	Q92614	Q9JMH9
RefSeq (мРНК)	NM_001346765 NM_001346766 NM_001346767 NM_001346768 NM_078471 NM_203318	NM_001291212 NM_001291213 NM_001291214 NM_001291215 NM_011586
RefSeq (білок)	NP_001333694 NP_001333695 NP_001333696 NP_001333697 NP_510880 NP_976063	NP_001278141 NP_001278142 NP_001278143 NP_001278144 NP_035716
Локус (UCSC)	Хр. 17: 29.07 – 29.18 Mb	Хр. 11: 77.76 – 77.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MYO18A (англ. Myosin XVIIIA) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 054 амінокислот, а молекулярна маса — 233 115.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFNLMKKDKD		KDGGRKEKKE		KKEKKERMSA		AELRSLEEMS		LRRGFFNLNR
SSKRESKTRL		EISNPIPIKV		ASGSDLHLTD		IDSDSNRGSV		ILDSGHLSTA
SSSDDLKGEE		GSFRGSVLQR		AAKFGSLAKQ		NSQMIVKRFS		FSQRSRDESA
SETSTPSEHS		AAPSPQVEVR		TLEGQLVQHP		GPGIPRPGHR		SRAPELVTKK
FPVDLRLPPV		VPLPPPTLRE		LELQRRPTGD		FGFSLRRTTM		LDRGPEGQAC
RRVVHFAEPG		AGTKDLALGL		VPGDRLVEIN		GHNVESKSRD		EIVEMIRQSG
DSVRLKVQPI		PELSELSRSW		LRSGEGPRRE		PSDAKTEEQI		AAEEAWNETE
KVWLVHRDGF		SLASQLKSEE		LNLPEGKVRV		KLDHDGAILD		VDEDDVEKAN
APSCDRLEDL		ASLVYLNESS		VLHTLRQRYG		ASLLHTYAGP		SLLVLGPRGA
PAVYSEKVMH		MFKGCRREDM		APHIYAVAQT		AYRAMLMSRQ		DQSIILLGSS
GSGKTTSCQH		LVQYLATIAG		ISGNKVFSVE		KWQALYTLLE		AFGNSPTIIN
GNATRFSQIL		SLDFDQAGQV		ASASIQTMLL		EKLRVARRPA		SEATFNVFYY
LLACGDGTLR		TELHLNHLAE		NNVFGIVPLA		KPEEKQKAAQ		QFSKLQAAMK
VLGISPDEQK		ACWFILAAIY		HLGAAGATKE		AAEAGRKQFA		RHEWAQKAAY
LLGCSLEELS		SAIFKHQHKG		GTLQRSTSFR		QGPEESGLGD		GTGPKLSALE
CLEGMAAGLY		SELFTLLVSL		VNRALKSSQH		SLCSMMIVDT		PGFQNPEQGG
SARGASFEEL		CHNYTQDRLQ		RLFHERTFVQ		ELERYKEENI		ELAFDDLEPP
TDDSVAAVDQ		ASHQSLVRSL		ARTDEARGLL		WLLEEEALVP		GASEDTLLER
LFSYYGPQEG		DKKGQSPLLH		SSKPHHFLLG		HSHGTNWVEY		NVTGWLNYTK
QNPATQNAPR		LLQDSQKKII		SNLFLGRAGS		ATVLSGSIAG		LEGGSQLALR
RATSMRKTFT		TGMAAVKKKS		LCIQMKLQVD		ALIDTIKKSK		LHFVHCFLPV
AEGWAGEPRS		ASSRRVSSSS		ELDLPSGDHC		EAGLLQLDVP		LLRTQLRGSR
LLDAMRMYRQ		GYPDHMVFSE		FRRRFDVLAP		HLTKKHGRNY		IVVDERRAVE
ELLECLDLEK		SSCCMGLSRV		FFRAGTLARL		EEQRDEQTSR		NLTLFQAACR
GYLARQHFKK		RKIQDLAIRC		VQKNIKKNKG		VKDWPWWKLF		TTVRPLIEVQ
LSEEQIRNKD		EEIQQLRSKL		EKAEKERNEL		RLNSDRLESR		ISELTSELTD
ERNTGESASQ		LLDAETAERL		RAEKEMKELQ		TQYDALKKQM		EVMEMEVMEA
RLIRAAEING		EVDDDDAGGE		WRLKYERAVR		EVDFTKKRLQ		QEFEDKLEVE
QQNKRQLERR		LGDLQADSEE		SQRALQQLKK		KCQRLTAELQ		DTKLHLEGQQ
VRNHELEKKQ		RRFDSELSQA		HEEAQREKLQ		REKLQREKDM		LLAEAFSLKQ
QLEEKDMDIA		GFTQKVVSLE		AELQDISSQE		SKDEASLAKV		KKQLRDLEAK
VKDQEEELDE		QAGTIQMLEQ		AKLRLEMEME		RMRQTHSKEM		ESRDEEVEEA
RQSCQKKLKQ		MEVQLEEEYE		DKQKVLREKR		ELEGKLATLS		DQVNRRDFES
EKRLRKDLKR		TKALLADAQL		MLDHLKNSAP		SKREIAQLKN		QLEESEFTCA
AAVKARKAME		VEIEDLHLQI		DDIAKAKTAL		EEQLSRLQRE		KNEIQNRLEE
DQEDMNELMK		KHKAAVAQAS		RDLAQINDLQ		AQLEEANKEK		QELQEKLQAL
QSQVEFLEQS		MVDKSLVSRQ		EAKIRELETR		LEFERTQVKR		LESLASRLKE
NMEKLTEERD		QRIAAENREK		EQNKRLQRQL		RDTKEEMGEL		ARKEAEASRK
KHELEMDLES		LEAANQSLQA		DLKLAFKRIG		DLQAAIEDEM		ESDENEDLIN
SLQDMVTKYQ		KRKNKLEGDS		DVDSELEDRV		DGVKSWLSKN		KGPSKAASDD
GSLKSSSPTS		YWKSLAPDRS		DDEHDPLDNT		SRPRYSHSYL		SDSDTEAKLT
ETNA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, міозинів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, апараті гольджі.

Література

• Homma K., Kikuno R.F., Nagase T., Ohara O., Nishikawa K. (2004). Alternative splice variants encoding unstable protein domains exist in the human brain. J. Mol. Biol. 343: 1207—1220. PMID 15491607 DOI:10.1016/j.jmb.2004.09.028
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tan I., Yong J., Dong J.M., Lim L., Leung T. (2008). A tripartite complex containing MRCK modulates lamellar actomyosin retrograde flow. Cell. 135: 123—136. PMID 18854160 DOI:10.1016/j.cell.2008.09.018
• Ng M.M., Dippold H.C., Buschman M.D., Noakes C.J., Field S.J. (2013). GOLPH3L antagonizes GOLPH3 to determine Golgi morphology. Mol. Biol. Cell. 24: 796—808. PMID 23345592 DOI:10.1091/mbc.E12-07-0525

Див. також

• Хромосома 17