LMO7

LMO7
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EAQ
Ідентифікатори
Символи	LMO7, FBX20, FBXO20, LOMP, LIM domain 7, LMO7b
Зовнішні ІД	OMIM: 604362 MGI: 1353586 HomoloGene: 83924 GeneCards: LMO7
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет 1-го типу
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • цитоплазма • ubiquitin ligase complex • клітинне ядро • focal adhesion • гіалоплазма • nuclear envelope • cell surface • apical plasma membrane Біологічний процес • regulation of cell adhesion • Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of signaling • protein polyubiquitination • посттрансляційна модифікація • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4008	380928
Ensembl	ENSG00000136153	ENSMUSG00000033060
UniProt	Q8WWI1	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001306080 NM_005358 NM_015842 NM_015843 NM_001330583	NM_201529 NM_001347628
RefSeq (білок)	NP_001293009 NP_001317512 NP_005349 NP_056667 NP_001353561 NP_001353562 NP_001353563 NP_001353565 NP_001293009.1	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 13: 75.62 – 75.86 Mb	Хр. 14: 101.73 – 101.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LMO7 (англ. LIM domain 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 683 амінокислот, а молекулярна маса — 192 696.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKKIRICHIF		TFYSWMSYDV		LFQRTELGAL		EIWRQLICAH		VCICVGWLYL
RDRVCSKKDI		ILRTEQNSGR		TILIKAVTEK		NFETKDFRAS		LENGVLLCDL
INKLKPGVIK		KINRLSTPIA		GLDNINVFLK		ACEQIGLKEA		QLFHPGDLQD
LSNRVTVKQE		ETDRRVKNVL		ITLYWLGRKA		QSNPYYNGPH		LNLKAFENLL
GQALTKALED		SSFLKRSGRD		SGYGDIWCPE		RGEFLAPPRH		HKREDSFESL
DSLGSRSLTS		CSSDITLRGG		REGFESDTDS		EFTFKMQDYN		KDDMSYRRIS
AVEPKTALPF		NRFLPNKSRQ		PSYVPAPLRK		KKPDKHEDNR		RSWASPVYTE
ADGTFSSNQR		RIWGTNVENW		PTVQGTSKSS		CYLEEEKAKT		RSIPNIVKDD
LYVRKLSPVM		PNPGNAFDQF		LPKCWTPEDV		NWKRIKRETY		KPWYKEFQGF
SQFLLLQALQ		TYSDDILSSE		THTKIDPTSG		PRLITRRKNL		SYAPGYRRDD
LEMAALDPDL		ENDDFFVRKT		GVFHANPYVL		RAFEDFRKFS		EQDDSVERDI
ILQCREGELV		LPDLEKDDMI		VRRIPAQKKE		VPLSGAPDRY		HPVPFPEPWT
LPPEIQAKFL		CVFERTCPSK		EKSNSCRILV		PSYRQKKDDM		LTRKIQSWKL
GTTVPPISFT		PGPCSEADLK		RWEAIREASR		LRHKKRLMVE		RLFQKIYGEN
GSKSMSDVSA		EDVQNLRQLR		YEEMQKIKSQ		LKEQDQKWQD		DLAKWKDRRK
SYTSDLQKKK		EEREEIEKQA		LEKSKRSSKT		FKEMLQDRES		QNQKSTVPSR
RRMYSFDDVL		EEGKRPPTMT		VSEASYQSER		VEEKGATYPS		EIPKEDSTTF
AKREDRVTTE		IQLPSQSPVE		EQSPASLSSL		RSRSTQMEST		RVSASLPRSY
RKTDTVRLTS		VVTPRPFGSQ		TRGISSLPRS		YTMDDAWKYN		GDVEDIKRTP
NNVVSTPAPS		PDASQLASSL		SSQKEVAATE		EDVTRLPSPT		SPFSSLSQDQ
AATSKATLSS		TSGLDLMSES		GEGEISPQRE		VSRSQDQFSD		MRISINQTPG
KSLDFGFTIK		WDIPGIFVAS		VEAGSPAEFS		QLQVDDEIIA		INNTKFSYND
SKEWEEAMAK		AQETGHLVMD		VRRYGKAGSP		ETKWIDATSG		IYNSEKSSNL
SVTTDFSESL		QSSNIESKEI		NGIHDESNAF		ESKASESISL		KNLKRRSQFF
EQGSSDSVVP		DLPVPTISAP		SRWVWDQEEE		RKRQERWQKE		QDRLLQEKYQ
REQEKLREEW		QRAKQEAERE		NSKYLDEELM		VLSSNSMSLT		TREPSLATWE
ATWSEGSKSS		DREGTRAGEE		ERRQPQEEVV		HEDQGKKPQD		QLVIERERKW
EQQLQEEQEQ		KRLQAEAEEQ		KRPAEEQKRQ		AEIERETSVR		IYQYRRPVDS
YDIPKTEEAS		SGFLPGDRNK		SRSTTELDDY		STNKNGNNKY		LDQIGNMTSS
QRRSKKEQVP		SGAELERQQI		LQEMRKRTPL		HNDNSWIRQR		SASVNKEPVS
LPGIMRRGES		LDNLDSPRSN		SWRQPPWLNQ		PTGFYASSSV		QDFSRPPPQL
VSTSNRAYMR		NPSSSVPPPS		AGSVKTSTTG		VATTQSPTPR		SHSPSASQSG
SQLRNRSVSG		KRICSYCNNI		LGKGAAMIIE		SLGLCYHLHC		FKCVACECDL
GGSSSGAEVR		IRNHQLYCND		CYLRFKSGRP		TAM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 13