KLF5

KLF5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EBT
Ідентифікатори
Символи	KLF5, BTEB2, CKLF, IKLF, Kruppel-like factor 5 (intestinal), Kruppel like factor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 602903 MGI: 1338056 HomoloGene: 37520 GeneCards: KLF5
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • MRF binding Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • клітинне ядро • transcription regulator complex Біологічний процес • regulation of microvillus assembly • microvillus assembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • intestinal epithelial cell development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1950094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Ангіогенез • skeletal muscle cell differentiation • positive regulation of fat cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • positive regulation of cell population proliferation • cellular response to peptide • cellular response to leukemia inhibitory factor • cell-cell signaling via exosome • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • регуляція експресії генів • skeletal muscle satellite cell differentiation • satellite cell activation involved in skeletal muscle regeneration • myotube differentiation involved in skeletal muscle regeneration • skeletal muscle tissue regeneration • positive regulation of transcription by transcription factor localization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	688	12224
Ensembl	ENSG00000102554	ENSMUSG00000005148
UniProt	Q13887	Q9Z0Z7
RefSeq (мРНК)	NM_001730 NM_001286818	NM_009769
RefSeq (білок)	NP_001273747 NP_001721	NP_033899
Локус (UCSC)	Хр. 13: 73.05 – 73.08 Mb	Хр. 14: 99.54 – 99.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KLF5 (англ. Kruppel like factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 457 амінокислот, а молекулярна маса — 50 792.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATRVLSMSA		RLGPVPQPPA		PQDEPVFAQL		KPVLGAANPA		RDAALFPGEE
LKHAHHRPQA		QPAPAQAPQP		AQPPATGPRL		PPEDLVQTRC		EMEKYLTPQL
PPVPIIPEHK		KYRRDSASVV		DQFFTDTEGL		PYSINMNVFL		PDITHLRTGL
YKSQRPCVTH		IKTEPVAIFS		HQSETTAPPP		APTQALPEFT		SIFSSHQTAA
PEVNNIFIKQ		ELPTPDLHLS		VPTQQGHLYQ		LLNTPDLDMP		SSTNQTAAMD
TLNVSMSAAM		AGLNTHTSAV		PQTAVKQFQG		MPPCTYTMPS		QFLPQQATYF
PPSPPSSEPG		SPDRQAEMLQ		NLTPPPSYAA		TIASKLAIHN		PNLPTTLPVN
SQNIQPVRYN		RRSNPDLEKR		RIHYCDYPGC		TKVYTKSSHL		KAHLRTHTGE
KPYKCTWEGC		DWRFARSDEL		TRHYRKHTGA		KPFQCGVCNR		SFSRSDHLAL
HMKRHQN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Shi H., Zhang Z., Wang X., Liu S., Teng C.T. (1999). Isolation and characterization of a gene encoding human Kruppel-like factor 5 (IKLF): binding to the CAAT/GT box of the mouse lactoferrin gene promoter. Nucleic Acids Res. 27: 4807—4815. PMID 10572182 DOI:10.1093/nar/27.24.4807
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13