KCNIP4

KCNIP4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3DD4
Ідентифікатори
Символи	KCNIP4, CALP, KCHIP4, potassium voltage-gated channel interacting protein 4
Зовнішні ІД	OMIM: 608182 MGI: 1933131 HomoloGene: 23528 GeneCards: KCNIP4
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • potassium channel regulator activity • potassium channel activity • voltage-gated ion channel activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • ендоплазматичний ретикулум • мембрана Біологічний процес • potassium ion transport • regulation of ion transmembrane transport • protein localization to plasma membrane • ion transport • regulation of potassium ion transmembrane transport • potassium ion transmembrane transport • cardiac conduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80333	80334
Ensembl	ENSG00000185774 ENSG00000281758	ENSMUSG00000029088
UniProt	Q6PIL6	Q6PHZ8
RefSeq (мРНК)	NM_001035003 NM_001035004 NM_025221 NM_147181 NM_147182 NM_147183 NM_001363504	NM_001199242 NM_001199243 NM_001199244 NM_001199245 NM_030265
RefSeq (білок)	NP_001030175 NP_001030176 NP_079497 NP_671710 NP_671711 NP_671712 NP_001350433	NP_001186171 NP_001186172 NP_001186173 NP_001186174 NP_084541
Локус (UCSC)	Хр. 4: 20.73 – 21.95 Mb	Хр. 5: 48.39 – 49.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KCNIP4 (англ. Potassium voltage-gated channel interacting protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 250 амінокислот, а молекулярна маса — 28 729.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNVRRVESIS		AQLEEASSTG		GFLYAQNSTK		RSIKERLMKL		LPCSAAKTSS
PAIQNSVEDE		LEMATVRHRP		EALELLEAQS		KFTKKELQIL		YRGFKNECPS
GVVNEETFKE		IYSQFFPQGD		STTYAHFLFN		AFDTDHNGAV		SFEDFIKGLS
ILLRGTVQEK		LNWAFNLYDI		NKDGYITKEE		MLDIMKAIYD		MMGKCTYPVL
KEDAPRQHVE		TFFQKMDKNK		DGVVTIDEFI		ESCQKDENIM		RSMQLFENVI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, калію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Pruunsild P., Timmusk T. (2005). Structure, alternative splicing, and expression of the human and mouse KCNIP gene family. Genomics. 86: 581—593. PMID 16112838 DOI:10.1016/j.ygeno.2005.07.001
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jerng H.H., Pfaffinger P.J. (2008). Multiple Kv channel-interacting proteins contain an N-terminal transmembrane domain that regulates Kv4 channel trafficking and gating. J. Biol. Chem. 283: 36046—36059. PMID 18957440 DOI:10.1074/jbc.M806852200
• Kitazawa M., Kubo Y., Nakajo K. (2014). The stoichiometry and biophysical properties of the Kv4 potassium channel complex with K channel-interacting protein (KChIP) subunits are variable, depending on the relative expression level. J. Biol. Chem. 289: 17597—17609. PMID 24811166 DOI:10.1074/jbc.M114.563452

Див. також

• Хромосома 4