IRF2BP1

IRF2BP1
Ідентифікатори
Символи	IRF2BP1, interferon regulatory factor 2 binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 615331 MGI: 2442159 HomoloGene: 32276 GeneCards: IRF2BP1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • protein polyubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26145	272359
Ensembl	ENSG00000170604	ENSMUSG00000044030
UniProt	Q8IU81	Q8R3Y8
RefSeq (мРНК)	NM_015649	NM_178757
RefSeq (білок)	NP_056464	NP_848872
Локус (UCSC)	Хр. 19: 45.88 – 45.89 Mb	Хр. 7: 18.74 – 18.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IRF2BP1 (англ. Interferon regulatory factor 2 binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 584 амінокислот, а молекулярна маса — 61 688.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASVQASRRQ		WCYLCDLPKM		PWAMVWDFSE		AVCRGCVNFE		GADRIELLID
AARQLKRSHV		LPEGRSPGPP		ALKHPATKDL		AAAAAQGPQL		PPPQAQPQPS
GTGGGVSGQD		RYDRATSSGR		LPLPSPALEY		TLGSRLANGL		GREEAVAEGA
RRALLGSMPG		LMPPGLLAAA		VSGLGSRGLT		LAPGLSPARP		LFGSDFEKEK
QQRNADCLAE		LNEAMRGRAE		EWHGRPKAVR		EQLLALSACA		PFNVRFKKDH
GLVGRVFAFD		ATARPPGYEF		ELKLFTEYPC		GSGNVYAGVL		AVARQMFHDA
LREPGKALAS		SGFKYLEYER		RHGSGEWRQL		GELLTDGVRS		FREPAPAEAL
PQQYPEPAPA		ALCGPPPRAP		SRNLAPTPRR		RKASPEPEGE		AAGKMTTEEQ
QQRHWVAPGG		PYSAETPGVP		SPIAALKNVA		EALGHSPKDP		GGGGGPVRAG
GASPAASSTA		QPPTQHRLVA		RNGEAEVSPT		AGAEAVSGGG		SGTGATPGAP
LCCTLCRERL		EDTHFVQCPS		VPGHKFCFPC		SREFIKAQGP		AGEVYCPSGD
KCPLVGSSVP		WAFMQGEIAT		ILAGDIKVKK		ERDP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Childs K.S., Goodbourn S. (2003). Identification of novel co-repressor molecules for interferon regulatory factor-2. Nucleic Acids Res. 31: 3016—3026. PMID 12799427 DOI:10.1093/nar/gkg431
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kimura M. (2008). IRF2-binding protein-1 is a JDP2 ubiquitin ligase and an inhibitor of ATF2-dependent transcription. FEBS Lett. 582: 2833—2837. PMID 18671972 DOI:10.1016/j.febslet.2008.07.033

Див. також

• Хромосома 19