HABP4

HABP4
Ідентифікатори
Символи	HABP4, IHABP-4, IKi-1/57, SERBP1L, hyaluronan binding protein 4
Зовнішні ІД	OMIM: 617369 MGI: 1891713 HomoloGene: 8615 GeneCards: HABP4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • SUMO binding Клітинна компонента • extracellular region • саркомера • клітинне ядро • цитоплазма • ядерце • Тільце Кахаля • Саркоплазма • ядерні тільця • nuclear speck • gemini of coiled bodies • гіалоплазма • cytoplasmic stress granule Біологічний процес • negative regulation of DNA binding • cellular response to mechanical stimulus • platelet degranulation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of RNA splicing • positive regulation of translational initiation • mRNA processing • regulation of translation • Сплайсинг РНК • PML body organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22927	56541
Ensembl	ENSG00000130956	ENSMUSG00000021476
UniProt	Q5JVS0	Q9JKS5
RefSeq (мРНК)	NM_014282	NM_019986
RefSeq (білок)	NP_055097	NP_064370
Локус (UCSC)	Хр. 9: 96.45 – 96.49 Mb	Хр. 13: 64.31 – 64.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HABP4 (англ. Hyaluronan binding protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 413 амінокислот, а молекулярна маса — 45 785.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKGALGSPVA		AAGAAMQESF		GCVVANRFHQ		LLDDESDPFD		ILREAERRRQ
QQLQRKRRDE		AAAAAGAGPR		GGRSPAGASG		HRAGAGGRRE		SQKERKSLPA
PVAQRPDSPG		GGLQAPGQKR		TPRRGEQQGW		NDSRGPEGML		ERAERRSYRE
YRPYETERQA		DFTAEKFPDE		KPGDRFDRDR		PLRGRGGPRG		GMRGRGRGGP
GNRVFDAFDQ		RGKREFERYG		GNDKIAVRTE		DNMGGCGVRT		WGSGKDTSDV
EPTAPMEEPT		VVEESQGTPE		EESPAKVPEL		EVEEETQVQE		MTLDEWKNLQ
EQTRPKPEFN		IRKPESTVPS		KAVVIHKSKY		RDDMVKDDYE		DDSHVFRKPA
NDITSQLEIN		FGNLPRPGRG		ARGGTRGGRG		RIRRAENYGP		RAEVVMQDVA
PNPDDPEDFP		ALS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Huang L., Grammatikakis N., Yoneda M., Banerjee S.D., Toole B.P. (2000). Molecular characterization of a novel intracellular hyaluronan-binding protein. J. Biol. Chem. 275: 29829—29839. PMID 10887182 DOI:10.1074/jbc.M002737200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lemos T.A., Passos D.O., Nery F.C., Kobarg J. (2003). Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3. FEBS Lett. 533: 14—20. PMID 12505151 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03737-7
• Nery F.C., Passos D.O., Garcia V.S., Kobarg J. (2004). Ki-1/57 interacts with RACK1 and is a substrate for the phosphorylation by phorbol 12-myristate 13-acetate-activated protein kinase C. J. Biol. Chem. 279: 11444—11455. PMID 14699138 DOI:10.1074/jbc.M306672200
• Nery F.C., Rui E., Kuniyoshi T.M., Kobarg J. (2006). Evidence for the interaction of the regulatory protein Ki-1/57 with p53 and its interacting proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 341: 847—855. PMID 16455055 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.01.036

Див. також

• Хромосома 9