GAP43

GAP43
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4E53
Ідентифікатори
Символи	GAP43, B-50, PP46, growth associated protein 43, GAP-43
Зовнішні ІД	OMIM: 162060 MGI: 95639 HomoloGene: 1545 GeneCards: GAP43
Онтологія гена Молекулярна функція • lysophosphatidic acid binding • phosphatidylinositol phosphate binding • phosphatidylserine binding • calmodulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • cell projection • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • growth cone membrane • синапс • аксон • міжклітинні контакти • cell periphery • filopodium membrane • клітинна мембрана • GABA-ergic synapse Біологічний процес • regulation of filopodium assembly • диференціація клітин • cell fate commitment • tissue regeneration • glial cell differentiation • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • protein kinase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • response to wounding • regulation of growth • axon choice point recognition • axon development • axon guidance • regulation of postsynaptic specialization assembly • axon regeneration Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2596	14432
Ensembl	ENSG00000172020	ENSMUSG00000047261
UniProt	P17677	P06837
RefSeq (мРНК)	NM_002045 NM_001130064	NM_008083
RefSeq (білок)	NP_001123536 NP_002036	NP_032109
Локус (UCSC)	Хр. 3: 115.62 – 115.72 Mb	Хр. 16: 42.07 – 42.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GAP43 (англ. Growth associated protein 43) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 238 амінокислот, а молекулярна маса — 24 803.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLCCMRRTKQ		VEKNDDDQKI		EQDGIKPEDK		AHKAATKIQA		SFRGHITRKK
LKGEKKDDVQ		AAEAEANKKD		EAPVADGVEK		KGEGTTTAEA		APATGSKPDE
PGKAGETPSE		EKKGEGDAAT		EQAAPQAPAS		SEEKAGSAET		ESATKASTDN
SPSSKAEDAP		AKEEPKQADV		PAAVTAAAAT		TPAAEDAAAK		ATAQPPTETG
ESSQAEENIE		AVDETKPKES		ARQDEGKEEE		PEADQEHA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін

V: Валін

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція росту, диференціація, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

• Ng S.-C., de la Monte S.M., Conboy G.L., Karns L.R., Fishman M.C. (1988). Cloning of human GAP-43: growth association and ischemic resurgence. Neuron. 1: 133—139. PMID 3272163 DOI:10.1016/0896-6273(88)90197-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gauthier-Campbell C., Bredt D.S., Murphy T.H., El-Husseini A. (2004). Regulation of dendritic branching and filopodia formation in hippocampal neurons by specific acylated protein motifs. Mol. Biol. Cell. 15: 2205—2217. PMID 14978216 DOI:10.1091/mbc.E03-07-0493
• Tomatis V.M., Trenchi A., Gomez G.A., Daniotti J.L. (2010). Acyl-protein thioesterase 2 catalyzes the deacylation of peripheral membrane-associated GAP-43. PLoS ONE. 5: E15045—E15045. PMID 21152083 DOI:10.1371/journal.pone.0015045

Див. також

• Хромосома 3