FOXK1

FOXK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2A3S, 2D2W
Ідентифікатори
Символи	FOXK1, FOXK1L, forkhead box K1
Зовнішні ІД	OMIM: 616302 MGI: 1347488 HomoloGene: 82414 GeneCards: FOXK1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1950094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • muscle organ development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • protein deubiquitination • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	221937	17425
Ensembl	ENSG00000164916	ENSMUSG00000056493
UniProt	P85037	P42128
RefSeq (мРНК)	NM_001037165	NM_010812 NM_199068
RefSeq (білок)	NP_001032242	NP_951031
Локус (UCSC)	Хр. 7: 4.68 – 4.77 Mb	Хр. 5: 142.39 – 142.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FOXK1 (англ. Forkhead box K1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 733 амінокислот, а молекулярна маса — 75 457.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEVGEDSGA		RALLALRSAP		CSPVLCAAAA		AAAFPAAAPP		PAPAQPQPPP
GPPPPPPPPL		PPGAIAGAGS		SGGSSGVSGD		SAVAGAAPAL		VAAAAASVRQ
SPGPALARLE		GREFEFLMRQ		PSVTIGRNSS		QGSVDLSMGL		SSFISRRHLQ
LSFQEPHFYL		RCLGKNGVFV		DGAFQRRGAP		ALQLPKQCTF		RFPSTAIKIQ
FTSLYHKEEA		PASPLRPLYP		QISPLKIHIP		EPDLRSMVSP		VPSPTGTISV
PNSCPASPRG		AGSSSYRFVQ		NVTSDLQLAA		EFAAKAASEQ		QADTSGGDSP
KDESKPPFSY		AQLIVQAISS		AQDRQLTLSG		IYAHITKHYP		YYRTADKGWQ
NSIRHNLSLN		RYFIKVPRSQ		EEPGKGSFWR		IDPASEAKLV		EQAFRKRRQR
GVSCFRTPFG		PLSSRSAPAS		PTHPGLMSPR		SGGLQTPECL		SREGSPIPHD
PEFGSKLASV		PEYRYSQSAP		GSPVSAQPVI		MAVPPRPSSL		VAKPVAYMPA
SIVTSQQPAG		HAIHVVQQAP		TVTMVRVVTT		SANSANGYIL		TSQGAAGGSH
DAAGAAVLDL		GSEARGLEEK		PTIAFATIPA		AGGVIQTVAS		QMAPGVPGHT
VTILQPATPV		TLGQHHLPVR		AVTQNGKHAV		PTNSLAGNAY		ALTSPLQLLA
TQASSSAPVV		VTRVCEVGPK		EPAAAVAATA		TTTPATATTA		SASASSTGEP
EVKRSRVEEP		SGAVTTPAGV		IAAAGPQGPG		TGE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, міогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of human FOXK1 gene in silico. Int. J. Mol. Med. 14: 127—132. PMID 15202027
• Huang J.T., Lee V. (2004). Identification and characterization of a novel human FOXK1 gene in silico. Int. J. Oncol. 25: 751—757. PMID 15289879

Див. також

• Хромосома 7