ETV1

ETV1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4AVP, 4BNC
Ідентифікатори
Символи	ETV1, ER81, ETS variant 1, ETS variant transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600541 MGI: 99254 HomoloGene: 3636 GeneCards: ETV1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • peripheral nervous system neuron development • mechanosensory behavior • muscle organ development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • axon guidance • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1950094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2115	14009
Ensembl	ENSG00000006468	ENSMUSG00000004151
UniProt	P50549	P41164
RefSeq (мРНК)	NM_001163147 NM_001163148 NM_001163149 NM_001163150 NM_001163151 NM_001163152 NM_004956 NM_001370555 NM_001370556	NM_001163154 NM_007960 NM_001347379
RefSeq (білок)	NP_001156619 NP_001156620 NP_001156621 NP_001156622 NP_001156623 NP_001156624 NP_004947 NP_001357484 NP_001357485	NP_001156626 NP_001334308 NP_031986
Локус (UCSC)	Хр. 7: 13.89 – 13.99 Mb	Хр. 12: 38.83 – 38.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ETV1 (англ. ETS variant 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 477 амінокислот, а молекулярна маса — 55 131.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDGFYDQQVP		YMVTNSQRGR		NCNEKPTNVR		KRKFINRDLA		HDSEELFQDL
SQLQETWLAE		AQVPDNDEQF		VPDYQAESLA		FHGLPLKIKK		EPHSPCSEIS
SACSQEQPFK		FSYGEKCLYN		VSAYDQKPQV		GMRPSNPPTP		SSTPVSPLHH
ASPNSTHTPK		PDRAFPAHLP		PSQSIPDSSY		PMDHRFRRQL		SEPCNSFPPL
PTMPREGRPM		YQRQMSEPNI		PFPPQGFKQE		YHDPVYEHNT		MVGSAASQSF
PPPLMIKQEP		RDFAYDSEVP		SCHSIYMRQE		GFLAHPSRTE		GCMFEKGPRQ
FYDDTCVVPE		KFDGDIKQEP		GMYREGPTYQ		RRGSLQLWQF		LVALLDDPSN
SHFIAWTGRG		MEFKLIEPEE		VARRWGIQKN		RPAMNYDKLS		RSLRYYYEKG
IMQKVAGERY		VYKFVCDPEA		LFSMAFPDNQ		RPLLKTDMER		HINEEDTVPL
SHFDESMAYM		PEGGCCNPHP		YNEGYVY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wu J., Janknecht R. (2002). Regulation of the ETS transcription factor ER81 by the 90-kDa ribosomal S6 kinase 1 and protein kinase A. J. Biol. Chem. 277: 42669—42679. PMID 12213813 DOI:10.1074/jbc.M205501200
• Janknecht R. (2003). Regulation of the ER81 transcription factor and its coactivators by mitogen- and stress-activated protein kinase 1 (MSK1). Oncogene. 22: 746—755. PMID 12569367 DOI:10.1038/sj.onc.1206185
• Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 DOI:10.1074/jbc.M411718200

Див. також

• Хромосома 7