EIF4A3

EIF4A3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2HXY, 2HYI, 2J0Q, 2J0S, 2J0U, 2XB2, 3EX7, 4C9B
Ідентифікатори
Символи	EIF4A3, DDX48, MUK34, NMP265, NUK34, RCPS, eIF4AIII, eukaryotic translation initiation factor 4A3, Fal1, eIF4A-III, eIF-4A-III
Зовнішні ІД	OMIM: 608546 MGI: 1923731 HomoloGene: 5602 GeneCards: EIF4A3
Пов'язані генетичні захворювання
Richieri Costa-Pereira syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • selenocysteine insertion sequence binding • GO:0008026 helicase activity • poly(A) binding • RNA stem-loop binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • ribonucleoprotein complex binding • hydrolase activity • ATP binding • mRNA binding • RNA binding • translation regulator activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • мембрана • exon-exon junction complex • soma • дендрит (нейробіологія) • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце • glutamatergic synapse • postsynaptic cytosol • Рибонуклеопротеїни • U2-type catalytic step 1 spliceosome Біологічний процес • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • mRNA transport • negative regulation of translation • associative learning • GO:1904578 response to organic cyclic compound • regulation of mRNA binding • mRNA processing • positive regulation of translation • negative regulation of gene expression • negative regulation of excitatory postsynaptic potential • cellular response to brain-derived neurotrophic factor stimulus • cellular response to selenite ion • exploration behavior • RNA secondary structure unwinding • Сплайсинг РНК • rRNA processing • embryonic cranial skeleton morphogenesis • negative regulation of selenocysteine insertion sequence binding • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • regulation of translation • negative regulation of selenocysteine incorporation • mRNA splicing, via spliceosome • RNA export from nucleus • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome • GO:0015915 транспорт • regulation of translation at postsynapse, modulating synaptic transmission Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9775	192170
Ensembl	ENSG00000141543	ENSMUSG00000025580
UniProt	P38919	Q91VC3
RefSeq (мРНК)	NM_014740	NM_138669
RefSeq (білок)	NP_055555	NP_619610
Локус (UCSC)	Хр. 17: 80.13 – 80.15 Mb	Хр. 11: 119.18 – 119.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EIF4A3 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 4A3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 46 871.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATTATMATS		GSARKRLLKE		EDMTKVEFET		SEEVDVTPTF		DTMGLREDLL
RGIYAYGFEK		PSAIQQRAIK		QIIKGRDVIA		QSQSGTGKTA		TFSISVLQCL
DIQVRETQAL		ILAPTRELAV		QIQKGLLALG		DYMNVQCHAC		IGGTNVGEDI
RKLDYGQHVV		AGTPGRVFDM		IRRRSLRTRA		IKMLVLDEAD		EMLNKGFKEQ
IYDVYRYLPP		ATQVVLISAT		LPHEILEMTN		KFMTDPIRIL		VKRDELTLEG
IKQFFVAVER		EEWKFDTLCD		LYDTLTITQA		VIFCNTKRKV		DWLTEKMREA
NFTVSSMHGD		MPQKERESIM		KEFRSGASRV		LISTDVWARG		LDVPQVSLII
NYDLPNNREL		YIHRIGRSGR		YGRKGVAINF		VKNDDIRILR		DIEQYYSTQI
DEMPMNVADL		I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транспорт, процесинг рРНК, транспорт мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Shibuya T., Tange T.O., Sonenberg N., Moore M.J. (2004). eIF4AIII binds spliced mRNA in the exon junction complex and is essential for nonsense-mediated decay. Nat. Struct. Mol. Biol. 11: 346—351. PMID 15034551 DOI:10.1038/nsmb750
• Simmons H.M., Ruis B.L., Kapoor M., Hudacek A.W., Conklin K.F. (2005). Identification of NOM1, a nucleolar, eIF4A binding protein encoded within the chromosome 7q36 breakpoint region targeted in cases of pediatric acute myeloid leukemia. Gene. 347: 137—145. PMID 15715967 DOI:10.1016/j.gene.2004.12.027
• Tange T.O., Shibuya T., Jurica M.S., Moore M.J. (2005). Biochemical analysis of the EJC reveals two new factors and a stable tetrameric protein core. RNA. 11: 1869—1883. PMID 16314458 DOI:10.1261/rna.2155905
• Shibuya T., Tange T.O., Stroupe M.E., Moore M.J. (2006). Mutational analysis of human eIF4AIII identifies regions necessary for exon junction complex formation and nonsense-mediated mRNA decay. RNA. 12: 360—374. PMID 16495234 DOI:10.1261/rna.2190706

Див. також

• Хромосома 17