EIF3F

EIF3F
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3J8B, 3J8C
Ідентифікатори
Символи	EIF3F, EIF3S5, eIF3-p47, eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, MRT67
Зовнішні ІД	OMIM: 603914 MGI: 1913335 HomoloGene: 2783 GeneCards: EIF3F
шифр КФ	3.4.19.12
Пов'язані генетичні захворювання
депресія клінічна
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • translation initiation factor activity • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • translation initiation factor binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • eukaryotic translation initiation factor 3 complex • мембрана • eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m • eukaryotic 43S preinitiation complex • eukaryotic 48S preinitiation complex Біологічний процес • протеоліз • translational initiation • Біосинтез білків • IRES-dependent viral translational initiation • protein deubiquitination • formation of cytoplasmic translation initiation complex • cytoplasmic translational initiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8665	66085
Ensembl	ENSG00000175390	ENSMUSG00000031029
UniProt	O00303	Q9DCH4
RefSeq (мРНК)	NM_003754	NM_025344
RefSeq (білок)	NP_003745	NP_079620
Локус (UCSC)	Хр. 11: 7.97 – 8 Mb	Хр. 7: 108.53 – 108.54 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EIF3F (англ. Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 357 амінокислот, а молекулярна маса — 37 564.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATPAVPVSA		PPATPTPVPA		AAPASVPAPT		PAPAAAPVPA		AAPASSSDPA
AAAAATAAPG		QTPASAQAPA		QTPAPALPGP		ALPGPFPGGR		VVRLHPVILA
SIVDSYERRN		EGAARVIGTL		LGTVDKHSVE		VTNCFSVPHN		ESEDEVAVDM
EFAKNMYELH		KKVSPNELIL		GWYATGHDIT		EHSVLIHEYY		SREAPNPIHL
TVDTSLQNGR		MSIKAYVSTL		MGVPGRTMGV		MFTPLTVKYA		YYDTERIGVD
LIMKTCFSPN		RVIGLSSDLQ		QVGGASARIQ		DALSTVLQYA		EDVLSGKVSA
DNTVGRFLMS		LVNQVPKIVP		DDFETMLNSN		INDLLMVTYL		ANLTQSQIAL
NEKLVNL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, факторів ініціації, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як біосинтез білка, убіквітинування білків. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Holz M.K., Ballif B.A., Gygi S.P., Blenis J. (2005). mTOR and S6K1 mediate assembly of the translation preinitiation complex through dynamic protein interchange and ordered phosphorylation events. Cell. 123: 569—580. PMID 16286006 DOI:10.1016/j.cell.2005.10.024
• Kolupaeva V.G., Unbehaun A., Lomakin I.B., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2005). Binding of eukaryotic initiation factor 3 to ribosomal 40S subunits and its role in ribosomal dissociation and anti-association. RNA. 11: 470—486. PMID 15703437 DOI:10.1261/rna.7215305
• Masutani M., Sonenberg N., Yokoyama S., Imataka H. (2007). Reconstitution reveals the functional core of mammalian eIF3. EMBO J. 26: 3373—3383. PMID 17581632 DOI:10.1038/sj.emboj.7601765
• Lee A.S., Kranzusch P.J., Cate J.H. (2015). eIF3 targets cell-proliferation messenger RNAs for translational activation or repression. Nature. 522: 111—114. PMID 25849773 DOI:10.1038/nature14267
• Lee A.S., Kranzusch P.J., Doudna J.A., Cate J.H. (2016). eIF3d is an mRNA cap-binding protein that is required for specialized translation initiation. Nature. 536: 96—99. PMID 27462815 DOI:10.1038/nature18954

Див. також

• Хромосома 11