EBF1

EBF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3LYR, 3MQI
Ідентифікатори
Символи	EBF1, COE1, EBF, O/E-1, OLF1, early B-cell factor 1, early B cell factor 1, EBF transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 164343 MGI: 95275 HomoloGene: 7297 GeneCards: EBF1
Пов'язані генетичні захворювання
рак молочної залози, ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein dimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • C2H2 zinc finger domain binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1950094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1879	13591
Ensembl	ENSG00000164330	ENSMUSG00000057098
UniProt	Q9UH73	Q07802
RefSeq (мРНК)	NM_001290360 NM_024007 NM_182708 NM_001324101 NM_001324103 NM_001324106 NM_001324107 NM_001324108 NM_001324109 NM_001324111 NM_001364155 NM_001364156 NM_001364157 NM_001364158 NM_001364159	NM_001290709 NM_001290710 NM_001290711 NM_007897
RefSeq (білок)	NP_001277289 NP_001311030 NP_001311032 NP_001311035 NP_001311036 NP_001311037 NP_001311038 NP_001311040 NP_076870 NP_874367 NP_001351084 NP_001351085 NP_001351086 NP_001351087 NP_001351088	NP_001277638 NP_001277639 NP_001277640 NP_031923 NP_001349498 NP_001349500 NP_001349503 NP_001349504 NP_001349505 NP_001349506 NP_001349507 NP_001349508
Локус (UCSC)	Хр. 5: 158.7 – 159.1 Mb	Хр. 11: 44.62 – 45.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EBF1 (англ. Early B-cell factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 591 амінокислот, а молекулярна маса — 64 464.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFGIQESIQR		SGSSMKEEPL		GSGMNAVRTW		MQGAGVLDAN		TAAQSGVGLA
RAHFEKQPPS		NLRKSNFFHF		VLALYDRQGQ		PVEIERTAFV		GFVEKEKEAN
SEKTNNGIHY		RLQLLYSNGI		RTEQDFYVRL		IDSMTKQAIV		YEGQDKNPEM
CRVLLTHEIM		CSRCCDKKSC		GNRNETPSDP		VIIDRFFLKF		FLKCNQNCLK
NAGNPRDMRR		FQVVVSTTVN		VDGHVLAVSD		NMFVHNNSKH		GRRARRLDPS
EGTPSYLEHA		TPCIKAISPS		EGWTTGGATV		IIIGDNFFDG		LQVIFGTMLV
WSELITPHAI		RVQTPPRHIP		GVVEVTLSYK		SKQFCKGTPG		RFIYTALNEP
TIDYGFQRLQ		KVIPRHPGDP		ERLPKEVILK		RAADLVEALY		GMPHNNQEII
LKRAADIAEA		LYSVPRNHNQ		LPALANTSVH		AGMMGVNSFS		GQLAVNVSEA
SQATNQGFTR		NSSSVSPHGY		VPSTTPQQTN		YNSVTTSMNG		YGSAAMSNLG
GSPTFLNGSA		ANSPYAIVPS		SPTMASSTSL		PSNCSSSSGI		FSFSPANMVS
AVKQKSAFAP		VVRPQTSPPP		TCTSTNGNSL		QAISGMIVPP		M

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Gisler R., Jacobsen S.E., Sigvardsson M. (2000). Cloning of human early B-cell factor and identification of target genes suggest a conserved role in B-cell development in man and mouse. Blood. 96: 1457—1464. PMID 10942392

Див. також

• Хромосома 5