Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
E2F5
Ідентифікатори
Символи
E2F5 , E2F-5, E2F transcription factor 5
Зовнішні ІД
OMIM : 600967 MGI: 105091 HomoloGene: 1472 GeneCards: E2F5
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein dimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• цитоплазма • ядерце • клітинне ядро • transcription regulator complex • нуклеоплазма • fibrillar center • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес
• animal organ morphogenesis • regulation of cell cycle • cell projection organization • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 8: 85.18 – 85.22 Mb
Хр. 3: 14.64 – 14.67 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
E2F5 (англ. E2F transcription factor 5 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот , а молекулярна маса — 37 610[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAAAEPASSG QQAPAGQGQG QRPPPQPPQA QAPQPPPPPQ LGGAGGGSSR
HEKSLGLLTT KFVSLLQEAK DGVLDLKAAA DTLAVRQKRR IYDITNVLEG
IDLIEKKSKN SIQWKGVGAG CNTKEVIDRL RYLKAEIEDL ELKERELDQQ
KLWLQQSIKN VMDDSINNRF SYVTHEDICN CFNGDTLLAI QAPSGTQLEV
PIPEMGQNGQ KKYQINLKSH SGPIHVLLIN KESSSSKPVV FPVPPPDDLT
QPSSQSLTPV TPQKSSMATQ NLPEQHVSER SQALQQTSAT DISSAGSISG
DIIDELMSSD VFPLLRLSPT PADDYNFNLD DNEGVCDLFD VQILNY
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Hijmans E.M., Voorhoeve P.M., Beijersbergen R.L., van 't Veer L.J., Bernards R. (1995). E2F-5, a new E2F family member that interacts with p130 in vivo . Mol. Cell. Biol . 15 : 3082—3089. PMID 7760804 DOI :10.1128/MCB.15.6.3082
Vaishnav Y.N., Vaishnav M.Y., Pant V. (1998). The molecular and functional characterization of E2F-5 transcription factor. Biochem. Biophys. Res. Commun . 242 : 586—592. PMID 9464260 DOI :10.1006/bbrc.1997.8010
Rubin S.M., Gall A.-L., Zheng N., Pavletich N.P. (2005). Structure of the Rb C-terminal domain bound to E2F1-DP1: a mechanism for phosphorylation-induced E2F release. Cell . 123 : 1093—1106. PMID 16360038 DOI :10.1016/j.cell.2005.09.044
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші