DSCAML1

DSCAML1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1VA9
Ідентифікатори
Символи	DSCAML1, Dscaml1, 4921507G06Rik, 4930435C18Rik, BB239540, mKIAA1132, DSCAM2, DS cell adhesion molecule like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611782 MGI: 2150309 HomoloGene: 79549 GeneCards: DSCAML1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • cell-cell adhesion mediator activity Клітинна компонента • integral component of membrane • cell surface • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • синапс • мембрана • міжклітинний простір • аксон Біологічний процес • embryonic skeletal system morphogenesis • Детермінація • central nervous system development • brain development • адгезія клітин • dorsal/ventral pattern formation • аксоноґенеза • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • axon guidance • dendrite self-avoidance Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57453	114873
Ensembl	ENSG00000177103	ENSMUSG00000032087
UniProt	Q8TD84	Q4VA61
RefSeq (мРНК)	NM_020693 NM_001367904 NM_001367905	NM_001081270 NM_029039
RefSeq (білок)	NP_065744 NP_001354833 NP_001354834	NP_001074739
Локус (UCSC)	Хр. 11: 117.43 – 117.82 Mb	Хр. 9: 45.34 – 45.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DSCAML1 (англ. DS cell adhesion molecule like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 053 амінокислот, а молекулярна маса — 224 463.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWLVTFLLLL		DSLHKARPED		VGTSLYFVND		SLQQVTFSSS		VGVVVPCPAA
GSPSAALRWY		LATGDDIYDV		PHIRHVHANG		TLQLYPFSPS		AFNSFIHDND
YFCTAENAAG		KIRSPNIRVK		AVFREPYTVR		VEDQRSMRGN		VAVFKCLIPS
SVQEYVSVVS		WEKDTVSIIP		EHRFFITYHG		GLYISDVQKE		DALSTYRCIT
KHKYSGETRQ		SNGARLSVTD		PAESIPTILD		GFHSQEVWAG		HTVELPCTAS
GYPIPAIRWL		KDGRPLPADS		RWTKRITGLT		ISDLRTEDSG		TYICEVTNTF
GSAEATGILM		VIDPLHVTLT		PKKLKTGIGS		TVILSCALTG		SPEFTIRWYR
NTELVLPDEA		ISIRGLSNET		LLITSAQKSH		SGAYQCFATR		KAQTAQDFAI
IALEDGTPRI		VSSFSEKVVN		PGEQFSLMCA		AKGAPPPTVT		WALDDEPIVR
DGSHRTNQYT		MSDGTTISHM		NVTGPQIRDG		GVYRCTARNL		VGSAEYQARI
NVRGPPSIRA		MRNITAVAGR		DTLINCRVIG		YPYYSIKWYK		DALLLPDNHR
QVVFENGTLK		LTDVQKGMDE		GEYLCSVLIQ		PQLSISQSVH		VAVKVPPLIQ
PFEFPPASIG		QLLYIPCVVS		SGDMPIRITW		RKDGQVIISG		SGVTIESKEF
MSSLQISSVS		LKHNGNYTCI		ASNAAATVSR		ERQLIVRVPP		RFVVQPNNQD
GIYGKAGVLN		CSVDGYPPPK		VMWKHAKGSG		NPQQYHPVPL		TGRIQILPNS
SLLIRHVLEE		DIGYYLCQAS		NGVGTDISKS		MFLTVKIPAM		ITSHPNTTIA
IKGHAKELNC		TARGERPIII		RWEKGDTVID		PDRVMRYAIA		TKDNGDEVVS
TLKLKPADRG		DSVFFSCHAI		NSYGEDRGLI		QLTVQEPPDP		PELEIREVKA
RSMNLRWTQR		FDGNSIITGF		DIEYKNKSDS		WDFKQSTRNI		SPTINQANIV
DLHPASVYSI		RMYSFNKIGR		SEPSKELTIS		TEEAAPDGPP		MDVTLQPVTS
QSIQVTWKAP		KKELQNGVIR		GYQIGYRENS		PGSNGQYSIV		EMKATGDSEV
YTLDNLKKFA		QYGVVVQAFN		RAGTGPSSSE		INATTLEDVP		SQPPENVRAL
SITSDVAVIS		WSEPPRSTLN		GVLKGYRVIF		WSLYVDGEWG		EMQNITTTRE
RVELRGMEKF		TNYSVQVLAY		TQAGDGVRSS		VLYIQTKEDV		PGPPAGIKAV
PSSASSVVVS		WLPPTKPNGV		IRKYTIFCSS		PGSGQPAPSE		YETSPEQLFY
RIAHLNRGQQ		YLLWVAAVTS		AGRGNSSEKV		TIEPAGKAPA		KIISFGGTVT
TPWMKDVRLP		CNSVGDPAPA		VKWTKDSEDS		AIPVSMDGHR		LIHTNGTLLL
RAVKAEDSGY		YTCTATNTGG		FDTIIVNLLV		QVPPDQPRLT		VSKTSASSIT
LTWIPGDNGG		SSIRGFVLQY		SVDNSEEWKD		VFISSSERSF		KLDSLKCGTW
YKVKLAAKNS		VGSGRISEII		EAKTHGREPS		FSKDQHLFTH		INSTHARLNL
QGWNNGGCPI		TAIVLEYRPK		GTWAWQGLRA		NSSGEVFLTE		LREATWYELR
MRACNSAGCG		NETAQFATLD		YDGSTIPPIK		SAQGEGDDVK		KLFTIGCPVI
LATLGVALLF		IVRKKRKEKR		LKRLRDAKSL		AEMLISKNNR		SFDTPVKGPP
QGPRLHIDIP		RVQLLIEDKE		GIKQLGDDKA		TIPVTDAEFS		QAVNPQSFCT
GVSLHHPTLI		QSTGPLIDMS		DIRPGTNPVS		RKNVKSAHST		RNRYSSQWTL
TKCQASTPAR		TLTSDWRTVG		SQHGVTVTES		DSYSASLSQD		TDKGRNSMVS
TESASSTYEE		LARAYEHAKL		EEQLQHAKFE		ITECFISDSS		SDQMTTGTNE
NADSMTSMST		PSEPGICRFT		ASPPKPQDAD		RGKNVAVPIP		HRANKSDYCN
LPLYAKSEAF		FRKADGREPC		PVVPPREASI		RNLARTYHTQ		ARHLTLDPAS
KSLGLPHPGA		PAAASTATLP		QRTLAMPAPP		AGTAPPAPGP		TPAEPPTAPS
AAPPAPSTEP		PRAGGPHTKM		GGSRDSLLEM		STSGVGRSQK		QGAGAYSKSY
TLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Barlow G.M., Micales B., Chen X.-N., Lyons G.E., Korenberg J.R. (2002). Mammalian DSCAMs: roles in the development of the spinal cord, cortex, and cerebellum?. Biochem. Biophys. Res. Commun. 293: 881—891. PMID 12051741 DOI:10.1016/S0006-291X(02)00307-8

Див. також

• Хромосома 11