DERL1

DERL1
Ідентифікатори
Символи	DERL1, DER-1, DER1, derlin 1, derlin-1
Зовнішні ІД	OMIM: 608813 MGI: 1915069 HomoloGene: 11483 GeneCards: DERL1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • MHC class I protein binding • ubiquitin protein ligase binding • protease binding • ubiquitin-specific protease binding • ATPase binding • signaling receptor activity Клітинна компонента • early endosome • VCP-NPL4-UFD1 AAA ATPase complex • integral component of endoplasmic reticulum membrane • Derlin-1-VIMP complex • integral component of membrane • late endosome • мембрана • Derlin-1 retrotranslocation complex • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum membrane • signal recognition particle receptor complex • signal recognition particle Біологічний процес • Unfolded Protein Response • Відповідь на незгорнуті білки • ERAD pathway • positive regulation of protein binding • protein transport • protein destabilization • retrograde protein transport, ER to cytosol • GO:0022415 viral process • ER-associated misfolded protein catabolic process • protein homooligomerization • positive regulation of protein ubiquitination • establishment of protein localization • ubiquitin-dependent ERAD pathway • response to unfolded protein • згортання білків • трансмембранний транспорт • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0015915 транспорт • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79139	67819
Ensembl	ENSG00000136986	ENSMUSG00000022365
UniProt	Q9BUN8	Q99J56
RefSeq (мРНК)	NM_001134671 NM_024295 NM_001330601 NM_001363963	NM_024207
RefSeq (білок)	NP_001128143 NP_001317530 NP_077271 NP_001350892	NP_077169
Локус (UCSC)	Хр. 8: 123.01 – 123.04 Mb	Хр. 15: 57.73 – 57.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DERL1 (англ. Derlin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 251 амінокислот, а молекулярна маса — 28 801.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDIGDWFRS		IPAITRYWFA		ATVAVPLVGK		LGLISPAYLF		LWPEAFLYRF
QIWRPITATF		YFPVGPGTGF		LYLVNLYFLY		QYSTRLETGA		FDGRPADYLF
MLLFNWICIV		ITGLAMDMQL		LMIPLIMSVL		YVWAQLNRDM		IVSFWFGTRF
KACYLPWVIL		GFNYIIGGSV		INELIGNLVG		HLYFFLMFRY		PMDLGGRNFL
STPQFLYRWL		PSRRGGVSGF		GVPPASMRRA		ADQNGGGGRH		NWGQGFRLGD
Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, відповідь на порушення конформації білку, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lilley B.N., Ploegh H.L. (2004). A membrane protein required for dislocation of misfolded proteins from the ER. Nature. 429: 834—840. PMID 15215855 DOI:10.1038/nature02592
• Ye Y., Shibata Y., Yun C., Ron D., Rapoport T.A. (2004). A membrane protein complex mediates retro-translocation from the ER lumen into the cytosol. Nature. 429: 841—847. PMID 15215856 DOI:10.1038/nature02656
• Katiyar S., Joshi S., Lennarz W.J. (2005). The retrotranslocation protein derlin-1 binds peptide:N-glycanase to the endoplasmic reticulum. Mol. Biol. Cell. 16: 4584—4863. PMID 16055502 DOI:10.1091/mbc.E05-04-0345
• Lilley B.N., Ploegh H.L. (2005). Multiprotein complexes that link dislocation, ubiquitination, and extraction of misfolded proteins from the endoplasmic reticulum membrane. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 14296—14301. PMID 16186509 DOI:10.1073/pnas.0505014102
• Maruyama Y., Yamada M., Takahashi K., Yamada M. (2008). Ubiquitin ligase Kf-1 is involved in the endoplasmic reticulum-associated degradation pathway. Biochem. Biophys. Res. Commun. 374: 737—741. PMID 18675248 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.07.126

Див. також

• Хромосома 8