CTSF

CTSF
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1M6D
Ідентифікатори
Символи	CTSF, CATSF, CLN13, cathepsin F
Зовнішні ІД	OMIM: 603539 MGI: 1861434 HomoloGene: 31194 GeneCards: CTSF
Пов'язані генетичні захворювання
neuronal ceroid lipofuscinosis 13, adult neuronal ceroid lipofuscinosis
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • extracellular vesicle • лізосома • lysosomal lumen • екзосома • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8722	56464
Ensembl	ENSG00000174080	ENSMUSG00000083282
UniProt	Q9UBX1	Q9R013
RefSeq (мРНК)	NM_003793	NM_019861
RefSeq (білок)	NP_003784	NP_063914
Локус (UCSC)	Хр. 11: 66.56 – 66.57 Mb	Хр. 19: 4.91 – 4.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CTSF (англ. Cathepsin F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 484 амінокислот, а молекулярна маса — 53 366.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPWLQLLSL		LGLLPGAVAA		PAQPRAASFQ		AWGPPSPELL		APTRFALEMF
NRGRAAGTRA		VLGLVRGRVR		RAGQGSLYSL		EATLEEPPCN		DPMVCRLPVS
KKTLLCSFQV		LDELGRHVLL		RKDCGPVDTK		VPGAGEPKSA		FTQGSAMISS
LSQNHPDNRN		ETFSSVISLL		NEDPLSQDLP		VKMASIFKNF		VITYNRTYES
KEEARWRLSV		FVNNMVRAQK		IQALDRGTAQ		YGVTKFSDLT		EEEFRTIYLN
TLLRKEPGNK		MKQAKSVGDL		APPEWDWRSK		GAVTKVKDQG		MCGSCWAFSV
TGNVEGQWFL		NQGTLLSLSE		QELLDCDKMD		KACMGGLPSN		AYSAIKNLGG
LETEDDYSYQ		GHMQSCNFSA		EKAKVYINDS		VELSQNEQKL		AAWLAKRGPI
SVAINAFGMQ		FYRHGISRPL		RPLCSPWLID		HAVLLVGYGN		RSDVPFWAIK
NSWGTDWGEK		GYYYLHRGSG		ACGVNTMASS		AVVD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Локалізований у лізосомі.

Література

• Santamaria I., Velasco G., Pendas A.M., Paz A., Lopez-Otin C. (1999). Molecular cloning and structural and functional characterization of human cathepsin F, a new cysteine proteinase of the papain family with a long propeptide domain. J. Biol. Chem. 274: 13800—13809. PMID 10318784 DOI:10.1074/jbc.274.20.13800
• Naegler D.K., Sulea T., Menard R. (1999). Full-length cDNA of human cathepsin F predicts the presence of a cystatin domain at the N-terminus of the cysteine protease zymogen. Biochem. Biophys. Res. Commun. 257: 313—318. PMID 10198209 DOI:10.1006/bbrc.1999.0461
• Wex T., Wex H., Broemme D. (1999). The human cathepsin F gene -- a fusion product between an ancestral cathepsin and cystatin gene. Biol. Chem. 380: 1439—1442. PMID 10661872 DOI:10.1515/BC.1999.185
• Wex T., Levy B., Wex H., Bromme D. (1999). Human cathepsins F and W: a new subgroup of cathepsins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 259: 401—407. PMID 10362521 DOI:10.1006/bbrc.1999.0700
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Somoza J.R., Palmer J.T., Ho J.D. (2002). The crystal structure of human cathepsin F and its implications for the development of novel immunomodulators. J. Mol. Biol. 322: 559—568. PMID 12225749 DOI:10.1016/S0022-2836(02)00780-5

Див. також

• Хромосома 11