CSF2

CSF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1CSG, 2GMF, 4NKQ, 5C7X, 5D70, 5D71, 5D72, 4RS1
Ідентифікатори
Символи	CSF2, GMCSF, colony stimulating factor 2, CSF
Зовнішні ІД	OMIM: 138960 MGI: 1339752 HomoloGene: 600 GeneCards: CSF2
Онтологія гена Молекулярна функція • growth factor activity • granulocyte macrophage colony-stimulating factor receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine kinase activity • cytokine activity Клітинна компонента • extracellular region • внутрішньоклітинна мембранна органела • міжклітинний простір Біологічний процес • negative regulation of cytolysis • positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation • regulation of cell population proliferation • MAPK cascade • positive regulation of podosome assembly • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • positive regulation of interleukin-23 production • GO:1901313 positive regulation of gene expression • embryonic placenta development • epithelial fluid transport • регуляція експресії генів • dendritic cell differentiation • myeloid dendritic cell differentiation • macrophage activation • cellular response to lipopolysaccharide • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • monocyte differentiation • response to fluid shear stress • response to silicon dioxide • neutrophil differentiation • peptidyl-tyrosine phosphorylation • regulation of circadian sleep/wake cycle, sleep • histamine secretion • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • cellular response to granulocyte macrophage colony-stimulating factor stimulus • regulation of myeloid cell differentiation • regulation of signaling receptor activity • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cytokine-mediated signaling pathway • positive regulation of cell population proliferation • macrophage differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1437	12981
Ensembl	ENSG00000164400	ENSMUSG00000018916
UniProt	P04141	P01587
RefSeq (мРНК)	NM_000758	NM_009969
RefSeq (білок)	NP_000749	NP_034099
Локус (UCSC)	Хр. 5: 132.07 – 132.08 Mb	Хр. 11: 54.14 – 54.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CSF2 (англ. Colony stimulating factor 2) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 144 амінокислот, а молекулярна маса — 16 295.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWLQSLLLLG		TVACSISAPA		RSPSPSTQPW		EHVNAIQEAR		RLLNLSRDTA
AEMNETVEVI		SEMFDLQEPT		CLQTRLELYK		QGLRGSLTKL		KGPLTMMASH
YKQHCPPTPE		TSCATQIITF		ESFKENLKDF		LLVIPFDCWE		PVQE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, факторів росту. Задіяний у такому біологічному процесі, як поліморфізм. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kaushansky K., Lopez J.A., Brown C.B. (1992). Role of carbohydrate modification in the production and secretion of human granulocyte macrophage colony-stimulating factor in genetically engineered and normal mesenchymal cells. Biochemistry. 31: 1881—1886. PMID 1737041 DOI:10.1021/bi00121a042
• Diederichs K., Boone T., Karplus P.A. (1991). Novel fold and putative receptor binding site of granulocyte-macrophage colony-stimulating factor. Science. 254: 1779—1782. PMID 1837174 DOI:10.1126/science.1837174
• Miyatake S., Otsuka T., Yokota T., Lee F., Arai K. (1985). Structure of the chromosomal gene for granulocyte-macrophage colony stimulating factor: comparison of the mouse and human genes. EMBO J. 4: 2561—2568. PMID 3876930

Див. також

• Хромосома 5