COLGALT1

COLGALT1
Ідентифікатори
Символи	COLGALT1, GLT25D1, collagen beta(1-O)galactosyltransferase 1, ColGalT 1, BSVD3
Зовнішні ІД	OMIM: 617531 MGI: 1924348 HomoloGene: 23465 GeneCards: COLGALT1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • glycosyltransferase activity • procollagen galactosyltransferase activity Клітинна компонента • endoplasmic reticulum lumen • мембрана • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • positive regulation of collagen fibril organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79709	234407
Ensembl	ENSG00000130309	ENSMUSG00000034807
UniProt	Q8NBJ5	Q8K297
RefSeq (мРНК)	NM_024656	NM_146211 NM_001364443
RefSeq (білок)	NP_078932	NP_666323 NP_001351372
Локус (UCSC)	Хр. 19: 17.56 – 17.58 Mb	Хр. 8: 72.06 – 72.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COLGALT1 (англ. Collagen beta(1-O)galactosyltransferase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 622 амінокислот, а молекулярна маса — 71 636.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAPRAGRR		RGQPLLALLL		LLLAPLPPGA		PPGADAYFPE		ERWSPESPLQ
APRVLIALLA		RNAAHALPTT		LGALERLRHP		RERTALWVAT		DHNMDNTSTV
LREWLVAVKS		LYHSVEWRPA		EEPRSYPDEE		GPKHWSDSRY		EHVMKLRQAA
LKSARDMWAD		YILFVDADNL		ILNPDTLSLL		IAENKTVVAP		MLDSRAAYSN
FWCGMTSQGY		YKRTPAYIPI		RKRDRRGCFA		VPMVHSTFLI		DLRKAASRNL
AFYPPHPDYT		WSFDDIIVFA		FSCKQAEVQM		YVCNKEEYGF		LPVPLRAHST
LQDEAESFMH		VQLEVMVKHP		PAEPSRFISA		PTKTPDKMGF		DEVFMINLRR
RQDRRERMLR		ALQAQEIECR		LVEAVDGKAM		NTSQVEALGI		QMLPGYRDPY
HGRPLTKGEL		GCFLSHYNIW		KEVVDRGLQK		SLVFEDDLRF		EIFFKRRLMN
LMRDVEREGL		DWDLIYVGRK		RMQVEHPEKA		VPRVRNLVEA		DYSYWTLAYV
ISLQGARKLL		AAEPLSKMLP		VDEFLPVMFD		KHPVSEYKAH		FSLRNLHAFS
VEPLLIYPTH		YTGDDGYVSD		TETSVVWNNE		HVKTDWDRAK		SQKMREQQAL
SREAKNSDVL		QSPLDSAARD		EL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Локалізований у ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Schegg B., Huelsmeier A.J., Rutschmann C., Maag C., Hennet T. (2009). Core glycosylation of collagen is initiated by two beta(1-O)galactosyltransferases. Mol. Cell. Biol. 29: 943—952. PMID 19075007 DOI:10.1128/MCB.02085-07
• Liefhebber J.M., Punt S., Spaan W.J., van Leeuwen H.C. (2010). The human collagen beta(1-O)galactosyltransferase, GLT25D1, is a soluble endoplasmic reticulum localized protein. BMC Cell Biol. 11: 33—33. PMID 20470363 DOI:10.1186/1471-2121-11-33

Див. також

• Хромосома 19