CNTN2

CNTN2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2OM5
Ідентифікатори
Символи	CNTN2, AXT, FAME5, TAG-1, TAX, TAX1, contactin 2, transient axonal glycoprotein-1
Зовнішні ІД	OMIM: 190197 MGI: 104518 HomoloGene: 3720 GeneCards: CNTN2
Онтологія гена Молекулярна функція • protein self-association • identical protein binding • carbohydrate binding • cell-cell adhesion mediator activity Клітинна компонента • мембрана • myelin sheath • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • node of Ranvier • синапс • integral component of plasma membrane • cell surface • аксон • soma • anchored component of membrane • neuron projection • juxtaparanode region of axon • anchored component of postsynaptic membrane Біологічний процес • clustering of voltage-gated potassium channels • negative regulation of neuron differentiation • central nervous system myelination • receptor internalization • neuron migration • навчення • presynaptic membrane organization • regulation of astrocyte differentiation • regulation of axon diameter • адгезія клітин • positive regulation of protein processing • establishment of protein localization to juxtaparanode region of axon • positive regulation of adenosine receptor signaling pathway • cerebral cortex GABAergic interneuron migration • regulation of neuronal synaptic plasticity • protein localization to juxtaparanode region of axon • regulation of cell morphogenesis involved in differentiation • neuron projection development • axonal fasciculation • microtubule cytoskeleton organization • adult walking behavior • axon guidance • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • dendrite self-avoidance Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6900	21367
Ensembl	ENSG00000184144	ENSMUSG00000053024
UniProt	Q02246	Q61330
RefSeq (мРНК)	NM_005076 NM_001346083	NM_011531 NM_177129
RefSeq (білок)	NP_001333012 NP_005067	NP_796103
Локус (UCSC)	Хр. 1: 205.04 – 205.08 Mb	Хр. 1: 132.44 – 132.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CNTN2 (англ. Contactin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 040 амінокислот, а молекулярна маса — 113 393.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGTATRRKPH		LLLVAAVALV		SSSAWSSALG		SQTTFGPVFE		DQPLSVLFPE
ESTEEQVLLA		CRARASPPAT		YRWKMNGTEM		KLEPGSRHQL		VGGNLVIMNP
TKAQDAGVYQ		CLASNPVGTV		VSREAILRFG		FLQEFSKEER		DPVKAHEGWG
VMLPCNPPAH		YPGLSYRWLL		NEFPNFIPTD		GRHFVSQTTG		NLYIARTNAS
DLGNYSCLAT		SHMDFSTKSV		FSKFAQLNLA		AEDTRLFAPS		IKARFPAETY
ALVGQQVTLE		CFAFGNPVPR		IKWRKVDGSL		SPQWTTAEPT		LQIPSVSFED
EGTYECEAEN		SKGRDTVQGR		IIVQAQPEWL		KVISDTEADI		GSNLRWGCAA
AGKPRPTVRW		LRNGEPLASQ		NRVEVLAGDL		RFSKLSLEDS		GMYQCVAENK
HGTIYASAEL		AVQALAPDFR		LNPVRRLIPA		ARGGEILIPC		QPRAAPKAVV
LWSKGTEILV		NSSRVTVTPD		GTLIIRNISR		SDEGKYTCFA		ENFMGKANST
GILSVRDATK		ITLAPSSADI		NLGDNLTLQC		HASHDPTMDL		TFTWTLDDFP
IDFDKPGGHY		RRTNVKETIG		DLTILNAQLR		HGGKYTCMAQ		TVVDSASKEA
TVLVRGPPGP		PGGVVVRDIG		DTTIQLSWSR		GFDNHSPIAK		YTLQARTPPA
GKWKQVRTNP		ANIEGNAETA		QVLGLTPWMD		YEFRVIASNI		LGTGEPSGPS
SKIRTREAAP		SVAPSGLSGG		GGAPGELIVN		WTPMSREYQN		GDGFGYLLSF
RRQGSTHWQT		ARVPGADAQY		FVYSNESVRP		YTPFEVKIRS		YNRRGDGPES
LTALVYSAEE		EPRVAPTKVW		AKGVSSSEMN		VTWEPVQQDM		NGILLGYEIR
YWKAGDKEAA		ADRVRTAGLD		TSARVSGLHP		NTKYHVTVRA		YNRAGTGPAS
PSANATTMKP		PPRRPPGNIS		WTFSSSSLSI		KWDPVVPFRN		ESAVTGYKML
YQNDLHLTPT		LHLTGKNWIE		IPVPEDIGHA		LVQIRTTGPG		GDGIPAEVHI
VRNGGTSMMV		ENMAVRPAPH		PGTVISHSVA		MLILIGSLEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Hasler T.H., Rader C., Stoeckli E.T., Zuellig R.A., Sonderegger P. (1993). cDNA cloning, structural features, and eucaryotic expression of human TAG-1/axonin-1. Eur. J. Biochem. 211: 329—339. PMID 8425542 DOI:10.1111/j.1432-1033.1993.tb19902.x
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Mortl M., Sonderegger P., Diederichs K., Welte W. (2007). The crystal structure of the ligand-binding module of human TAG-1 suggests a new mode of homophilic interaction. Protein Sci. 16: 2174—2183. PMID 17766378 DOI:10.1110/ps.072802707

Див. також

• Хромосома 1