CLK3

CLK3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EU9, 2EXE, 2WU6, 2WU7, 3RAW
Ідентифікатори
Символи	CLK3, PHPHCLK3/152, CDC like kinase 3
Зовнішні ІД	OMIM: 602990 MGI: 1098670 HomoloGene: 101534 GeneCards: CLK3
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein serine/threonine/tyrosine kinase activity • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • identical protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • мембрана • нуклеоплазма • Акросома • intermediate filament cytoskeleton • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро Біологічний процес • фосфорилювання • protein phosphorylation • regulation of RNA splicing • protein autophosphorylation • peptidyl-tyrosine phosphorylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1198	102414
Ensembl	ENSG00000179335	ENSMUSG00000032316
UniProt	P49761	O35492
RefSeq (мРНК)	NM_001130028 NM_001292 NM_003992	NM_007713
RefSeq (білок)	NP_001123500 NP_003983	NP_031739
Локус (UCSC)	Хр. 15: 74.6 – 74.65 Mb	Хр. 9: 57.66 – 57.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLK3 (англ. CDC like kinase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 638 амінокислот, а молекулярна маса — 73 515.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPVLSARRRE		LADHAGSGRR		SGPSPTARSG		PHLSALRAQP		ARAAHLSGRG
TYVRRDTAGG		GPGQARPLGP		PGTSLLGRGA		RRSGEGWCPG		AFESGARAAR
PPSRVEPRLA		TAASREGAGL		PRAEVAAGSG		RGARSGEWGL		AAAGAWETMH
HCKRYRSPEP		DPYLSYRWKR		RRSYSREHEG		RLRYPSRREP		PPRRSRSRSH
DRLPYQRRYR		ERRDSDTYRC		EERSPSFGED		YYGPSRSRHR		RRSRERGPYR
TRKHAHHCHK		RRTRSCSSAS		SRSQQSSKRS		SRSVEDDKEG		HLVCRIGDWL
QERYEIVGNL		GEGTFGKVVE		CLDHARGKSQ		VALKIIRNVG		KYREAARLEI
NVLKKIKEKD		KENKFLCVLM		SDWFNFHGHM		CIAFELLGKN		TFEFLKENNF
QPYPLPHVRH		MAYQLCHALR		FLHENQLTHT		DLKPENILFV		NSEFETLYNE
HKSCEEKSVK		NTSIRVADFG		SATFDHEHHT		TIVATRHYRP		PEVILELGWA
QPCDVWSIGC		ILFEYYRGFT		LFQTHENREH		LVMMEKILGP		IPSHMIHRTR
KQKYFYKGGL		VWDENSSDGR		YVKENCKPLK		SYMLQDSLEH		VQLFDLMRRM
LEFDPAQRIT		LAEALLHPFF		AGLTPEERSF		HTSRNPSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, цитоплазматичних везикулах.

Література

• Hanes J.J., der Kammer H., Klaudiny J.J., Scheit K.H. (1994). Characterization by cDNA cloning of two new human protein kinases. Evidence by sequence comparison of a new family of mammalian protein kinases. J. Mol. Biol. 244: 665—672. PMID 7990150 DOI:10.1006/jmbi.1994.1763
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Duncan P.I., Stojdl D.F., Marius R.M., Scheit K.H., Bell J.C. (1998). The Clk2 and Clk3 dual-specificity protein kinases regulate the intranuclear distribution of SR proteins and influence pre-mRNA splicing. Exp. Cell Res. 241: 300—308. PMID 9637771 DOI:10.1006/excr.1998.4083
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Див. також

• Хромосома 15