CLEC4C

CLEC4C
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 3WBP, 3WBQ, 3WBR, 4ZES, 4ZET
Ідентифікатори
Символи	CLEC4C, BDCA2, CD303, CLECSF11, CLECSF7, DLEC, HECL, PRO34150, C-type lectin domain family 4 member C, BDCA-2
Зовнішні ІД	OMIM: 606677 MGI: 1917060 HomoloGene: 130350 GeneCards: CLEC4C
Онтологія гена Молекулярна функція • carbohydrate binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • secretory granule membrane • tertiary granule membrane • ficolin-1-rich granule membrane • клітинна мембрана Біологічний процес • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • вроджений імунітет • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	170482	69810
Ensembl	ENSG00000198178	ENSMUSG00000030147
UniProt	Q8WTT0	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_203503 NM_130441 NM_001371390 NM_001371391	NM_001190310 NM_027218
RefSeq (білок)	NP_569708 NP_987099 NP_001358319 NP_001358320	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 12: 7.73 – 7.75 Mb	Хр. 6: 123.03 – 123.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLEC4C (англ. C-type lectin domain family 4 member C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 213 амінокислот, а молекулярна маса — 25 038.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVPEEEPQDR		EKGLWWFQLK		VWSMAVVSIL		LLSVCFTVSS		VVPHNFMYSK
TVKRLSKLRE		YQQYHPSLTC		VMEGKDIEDW		SCCPTPWTSF		QSSCYFISTG
MQSWTKSQKN		CSVMGADLVV		INTREEQDFI		IQNLKRNSSY		FLGLSDPGGR
RHWQWVDQTP		YNENVTFWHS		GEPNNLDERC		AIINFRSSEE		WGWNDIHCHV
PQKSICKMKK		IYI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fernandes M.J., Iscove N.N., Gingras G., Calabretta B. (2000). Identification and characterization of the gene for a novel C-type lectin (CLECSF7) that maps near the natural killer gene complex on human chromosome 12. Genomics. 69: 263—270. PMID 11031109 DOI:10.1006/geno.2000.6316

Див. також

• Хромосома 12