CCNT1

CCNT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2PK2, 3BLH, 3BLQ, 3BLR, 3LQ5, 3MI9, 3MIA, 3MY1, 3TN8, 3TNH, 3TNI, 4BCF, 4BCG, 4BCH, 4BCI, 4BCJ, 4EC8, 4EC9, 4IMY, 4OGR, 4OR5
Ідентифікатори
Символи	CCNT1, CCNT, CYCT1, HIVE1, cyclin T1
Зовнішні ІД	OMIM: 143055 MGI: 1328363 HomoloGene: 947 GeneCards: CCNT1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • snRNA binding • chromatin binding • 7SK snRNA binding • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase binding • transcription factor binding • protein serine/threonine kinase activity • protein kinase binding • GO:0016534 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • ядерце • cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex • клітинне ядро • cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex Біологічний процес • regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • negative regulation of mRNA polyadenylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • transcription by RNA polymerase II • поділ клітини • protein phosphorylation • positive regulation of phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • positive regulation of viral transcription • клітинний цикл • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022415 viral process • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1950094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	904	12455
Ensembl	ENSG00000129315	ENSMUSG00000011960
UniProt	O60563	Q9QWV9
RefSeq (мРНК)	NM_001240 NM_001277842	NM_009833 NM_001368702
RefSeq (білок)	NP_001231 NP_001264771	NP_033963 NP_001355631
Локус (UCSC)	Хр. 12: 48.69 – 48.72 Mb	Хр. 15: 98.44 – 98.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CCNT1 (англ. Cyclin T1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 726 амінокислот, а молекулярна маса — 80 685.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGERKNNNK		RWYFTREQLE		NSPSRRFGVD		PDKELSYRQQ		AANLLQDMGQ
RLNVSQLTIN		TAIVYMHRFY		MIQSFTQFPG		NSVAPAALFL		AAKVEEQPKK
LEHVIKVAHT		CLHPQESLPD		TRSEAYLQQV		QDLVILESII		LQTLGFELTI
DHPHTHVVKC		TQLVRASKDL		AQTSYFMATN		SLHLTTFSLQ		YTPPVVACVC
IHLACKWSNW		EIPVSTDGKH		WWEYVDATVT		LELLDELTHE		FLQILEKTPN
RLKRIWNWRA		CEAAKKTKAD		DRGTDEKTSE		QTILNMISQS		SSDTTIAGLM
SMSTSTTSAV		PSLPVSEESS		SNLTSVEMLP		GKRWLSSQPS		FKLEPTQGHR
TSENLALTGV		DHSLPQDGSN		AFISQKQNSK		SVPSAKVSLK		EYRAKHAEEL
AAQKRQLENM		EANVKSQYAY		AAQNLLSHHD		SHSSVILKMP		IEGSENPERP
FLEKADKTAL		KMRIPVAGGD		KAASSKPEEI		KMRIKVHAAA		DKHNSVEDSV
TKSREHKEKH		KTHPSNHHHH		HNHHSHKHSH		SQLPVGTGNK		RPGDPKHSSQ
TSNLAHKTYS		LSSSFSSSSS		TRKRGPSEET		GGAVFDHPAK		IAKSTKSSSL
NFSFPSLPTM		GQMPGHSSDT		SGLSFSQPSC		KTRVPHSKLD		KGPTGANGHN
TTQTIDYQDT		VNMLHSLLSA		QGVQPTQPTA		FEFVRPYSDY		LNPRSGGISS
RSGNTDKPRP		PPLPSEPPPP		LPPLPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Wei P., Garber M.E., Fang S.-M., Fischer W.H., Jones K.A. (1998). A novel CDK9-associated C-type cyclin interacts directly with HIV-1 Tat and mediates its high-affinity, loop-specific binding to TAR RNA. Cell. 92: 451—462. PMID 9491887 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80939-3
• Peng J.-M., Zhu Y., Milton J.T., Price D.H. (1998). Identification of multiple cyclin subunits of human P-TEFb. Genes Dev. 12: 755—762. PMID 9499409 DOI:10.1101/gad.12.5.755
• Parada C.A., Roeder R.G. (1999). A novel RNA polymerase II-containing complex potentiates Tat-enhanced HIV-1 transcription. EMBO J. 18: 3688—3701. PMID 10393184 DOI:10.1093/emboj/18.13.3688
• Kwak Y.T., Ivanov D., Guo J., Nee E., Gaynor R.B. (1999). Role of the human and murine cyclin T proteins in regulating HIV-1 Tat-activation. J. Mol. Biol. 288: 57—69. PMID 10329126 DOI:10.1006/jmbi.1999.2664
• Fong Y.W., Zhou Q. (2000). Relief of two built-In autoinhibitory mechanisms in P-TEFb is required for assembly of a multicomponent transcription elongation complex at the human immunodeficiency virus type 1 promoter. Mol. Cell. Biol. 20: 5897—5907. PMID 10913173 DOI:10.1128/MCB.20.16.5897-5907.2000
• Young T.M., Wang Q., Pe'ery T., Mathews M.B. (2003). The human I-mfa domain-containing protein, HIC, interacts with cyclin T1 and modulates P-TEFb-dependent transcription. Mol. Cell. Biol. 23: 6373—6384. PMID 12944466 DOI:10.1128/MCB.23.18.6373-6384.2003

Див. також

• Хромосома 12