ARHGEF11

ARHGEF11
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1HTJ, 1XCG, 2DLS, 3KZ1, 3T06, 5E6P
Ідентифікатори
Символи	ARHGEF11, GTRAP48, PDZ-RHOGEF, Rho guanine nucleotide exchange factor 11
Зовнішні ІД	OMIM: 605708 MGI: 2441869 HomoloGene: 11409 GeneCards: ARHGEF11
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • G protein-coupled receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана Біологічний процес • G protein-coupled receptor signaling pathway • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cell growth • Rho protein signal transduction • establishment of cell polarity • positive regulation of apoptotic process • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • striated muscle contraction • actin cytoskeleton organization • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9826	213498
Ensembl	ENSG00000132694	ENSMUSG00000041977
UniProt	O15085	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_014784 NM_198236 NM_001377418 NM_001377419	NM_001003912 NM_001360195 NM_001360197
RefSeq (білок)	NP_055599 NP_937879 NP_001364347 NP_001364348	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 156.93 – 157.05 Mb	Хр. 3: 87.52 – 87.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARHGEF11 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 522 амінокислот, а молекулярна маса — 167 704.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVRLPQSID		RLSSLSSLGD		SAPERKSPSH		HRQPSDASET		TGLVQRCVII
QKDQHGFGFT		VSGDRIVLVQ		SVRPGGAAMK		AGVKEGDRII		KVNGTMVTNS
SHLEVVKLIK		SGAYVALTLL		GSSPSSMGIS		GLQQDPSPAG		APRITSVIPS
PPPPPPLPPP		QRITGPKPLQ		DPEVQKHATQ		ILRNMLRQEE		KELQDILPLY
GDTSQRPSEG		RLSLDSQEGD		SGLDSGTERF		PSLSESLMNR		NSVLSDPGLD
SPRTSPVIMA		RVAQHHRRQG		SDAAVPSTGD		QGVDQSPKPL		IIGPEEDYDP
GYFNNESDII		FQDLEKLKSR		PAHLGVFLRY		IFSQADPSPL		LFYLCAEVYQ
QASPKDSRSL		GKDIWNIFLE		KNAPLRVKIP		EMLQAEIDSR		LRNSEDARGV
LCEAQEAAMP		EIQEQIHDYR		TKRTLGLGSL		YGENDLLDLD		GDPLRERQVA
EKQLAALGDI		LSKYEEDRSA		PMDFALNTYM		SHAGIRLREA		RPSNTAEKAQ
SAPDKDKWLP		FFPKTKKSSN		SKKEKDALED		KKRNPILKYI		GKPKSSSQST
FHIPLSPVEV		KPGNVRNIIQ		HFENNQQYDA		PEPGTQRLST		GSFPEDLLES
DSSRSEIRLG		RSESLKGREE		MKRSRKAENV		PRSRSDVDMD		AAAEATRLHQ
SASSSTSSLS		TRSLENPTPP		FTPKMGRRSI		ESPSLGFCTD		TLLPHLLEDD
LGQLSDLEPE		PDAQNWQHTV		GKDVVAGLTQ		REIDRQEVIN		ELFVTEASHL
RTLRVLDLIF		YQRMKKENLM		PREELARLFP		NLPELIEIHN		SWCEAMKKLR
EEGPIIKEIS		DLMLARFDGP		AREELQQVAA		QFCSYQSIAL		ELIKTKQRKE
SRFQLFMQEA		ESHPQCRRLQ		LRDLIISEMQ		RLTKYPLLLE		SIIKHTEGGT
SEHEKLCRAR		DQCREILKYV		NEAVKQTENR		HRLEGYQKRL		DATALERASN
PLAAEFKSLD		LTTRKMIHEG		PLTWRISKDK		TLDLHVLLLE		DLLVLLQKQD
EKLLLKCHSK		TAVGSSDSKQ		TFSPVLKLNA		VLIRSVATDK		RAFFIICTSK
LGPPQIYELV		ALTSSDKNTW		MELLEEAVRN		ATRHPGAAPM		PVHPPPPGPR
EPAQQGPTPS		RVELDDSDVF		HGEPEPEELP		GGTGSQQRVQ		GKHQVLLEDP
EQEGSAEEEE		LGVLPCPSTS		LDGENRGIRT		RNPIHLAFPG		PLFMEGLADS
ALEDVENLRH		LILWSLLPGH		TMETQAAQEP		EDDLTPTPSV		ISVTSHPWDP
GSPGQAPPGG		EGDNTQLAGL		EGERPEQEDM		GLCSLEHLPP		RTRNSGIWES
PELDRNLAED		ASSTEAAGGY		KVVRKAEVAG		SKVVPALPES		GQSEPGPPEV
EGGTKATGNC		FYVSMPSGPP		DSSTDHSEAP		MSPPQPDSLP		AGQTEPQPQL
QGGNDDPRRP		SRSPPSLALR		DVGMIFHTIE		QLTLKLNRLK		DMELAHRELL
KSLGGESSGG		TTPVGSFHTE		AARWTDGSLS		PPAKEPLASD		SRNSHELGPC
PEDGSDAPLE		DSTADAAASP		GP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fukuhara S., Murga C., Zohar M., Igishi T., Gutkind J.S. (1999). A novel PDZ domain containing guanine nucleotide exchange factor links heterotrimeric G proteins to Rho. J. Biol. Chem. 274: 5868—5879. PMID 10026210 DOI:10.1074/jbc.274.9.5868
• Driessens M.H.E., Olivo C., Nagata K., Inagaki M., Collard J.G. (2002). B plexins activate Rho through PDZ-RhoGEF. FEBS Lett. 529: 168—172. PMID 12372863 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03323-9
• Perrot V., Vazquez-Prado J., Gutkind J.S. (2002). Plexin B regulates Rho through the guanine nucleotide exchange factors leukemia-associated Rho GEF (LARG) and PDZ-RhoGEF. J. Biol. Chem. 277: 43115—43120. PMID 12183458 DOI:10.1074/jbc.M206005200
• Togashi H., Nagata K., Takagishi M., Saitoh N., Inagaki M. (2000). Functions of a rho-specific guanine nucleotide exchange factor in neurite retraction. Possible role of a proline-rich motif of KIAA0380 in localization. J. Biol. Chem. 275: 29570—29578. PMID 10900204 DOI:10.1074/jbc.M003726200
• Lin M.Y., Lin Y.M., Kao T.C., Chuang H.H., Chen R.H. (2011). PDZ-RhoGEF ubiquitination by Cullin3-KLHL20 controls neurotrophin-induced neurite outgrowth. J. Cell Biol. 193: 985—994. PMID 21670212 DOI:10.1083/jcb.201103015

Див. також

• Хромосома 1