AFF3

AFF3
Ідентифікатори
Символи	AFF3, LAF4, MLLT2-like, AF4/FMR2 family member 3, KINS
Зовнішні ІД	OMIM: 601464 MGI: 106927 HomoloGene: 1718 GeneCards: AFF3
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет 1-го типу
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • double-stranded DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця • transcription elongation factor complex • super elongation complex Біологічний процес • response to tumor necrosis factor • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • embryonic hindlimb morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3899	16764
Ensembl	ENSG00000144218	ENSMUSG00000037138
UniProt	P51826	P51827
RefSeq (мРНК)	NM_001025108 NM_002285 NM_001386135	NM_001290814 NM_010678
RefSeq (білок)	NP_001020279 NP_002276	NP_001277743
Локус (UCSC)	Хр. 2: 99.55 – 100.19 Mb	Хр. 1: 38.22 – 38.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AFF3 (англ. AF4/FMR2 family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 226 амінокислот, а молекулярна маса — 133 476.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSFDLALLQ		EWDLESLCVY		EPDRNALRRK		ERERRNQETQ		QDDGTFNSSY
SLFSEPYKTN		KGDELSNRIQ		NTLGNYDEMK		DFLTDRSNQS		HLVGVPKPGV
PQTPVNKIDE		HFVADSRAQN		QPSSICSTTT		STPAAVPVQQ		SKRGTMGWQK
AGHPPSDGQQ		RATQQGSLRT		LLGDGVGRQQ		PRAKQVCNVE		VGLQTQERPP
AMAAKHSSSG		HCVQNFPPSL		ASKPSLVQQK		PTAYVRPMDG		QDQAPDESPK
LKSSSETSVH		CTSYRGVPAS		KPEPARAKAK		LSKFSIPKQG		EESRSGETNS
CVEEIIREMT		WLPPLSAIQA		PGKVEPTKFP		FPNKDSQLVS		SGHNNPKKGD
AEPESPDSGT		SNTSMLEDDL		KLSSDEEENE		QQAAQRTALR		ALSDSAVVQQ
PNCRTSVPSS		KGSSSSSSSG		SSSSSSDSES		SSGSDSETES		SSSESEGSKP
PHFSSPEAEP		ASSNKWQLDK		WLNKVNPHKP		PILIQNESHG		SESNQYYNPV
KEDVQDCGKV		PDVCQPSLRE		KEIKSTCKEE		QRPRTANKAP		GSKGVKQKSP
PAAVAVAVSA		AAPPPAVPCA		PAENAPAPAR		RSAGKKPTRR		TERTSAGDGA
NCHRPEEPAA		ADALGTSVVV		PPEPTKTRPC		GNNRASHRKE		LRSSVTCEKR
RTRGLSRIVP		KSKEFIETES		SSSSSSSDSD		LESEQEEYPL		SKAQTVAASA
SSGNDQRLKE		AAANGGSGPR		APVGSINART		TSDIAKELEE		QFYTLVPFGR
NELLSPLKDS		DEIRSLWVKI		DLTLLSRIPE		HLPQEPGVLS		APATKDSESA
PPSHTSDTPA		EKALPKSKRK		RKCDNEDDYR		EIKKSQGEKD		SSSRLATSTS
NTLSANHCNM		NINSVAIPIN		KNEKMLRSPI		SPLSDASKHK		YTSEDLTSSS
RPNGNSLFTS		ASSSKKPKAD		SQLQPHGGDL		TKAAHNNSEN		IPLHKSRPQT
KPWSPGSNGH		RDCKRQKLVF		DDMPRSADYF		MQEAKRMKHK		ADAMVEKFGK
ALNYAEAALS		FIECGNAMEQ		GPMESKSPYT		MYSETVELIR		YAMRLKTHSG
PNATPEDKQL		AALCYRCLAL		LYWRMFRLKR		DHAVKYSKAL		IDYFKNSSKA
AQAPSPWGAS		GKSTGTPSPM		SPNPSPASSV		GSQGSLSNAS		ALSPSTIVSI
PQRIHQMAAN		HVSITNSILH		SYDYWEMADN		LAKENREFFN		DLDLLMGPVT
LHSSMEHLVQ		YSQQGLHWLR		NSAHLS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ma C., Staudt L.M. (1996). LAF-4 encodes a lymphoid nuclear protein with transactivation potential that is homologous to AF-4, the gene fused to MLL in t(4;11) leukemias. Blood. 87: 734—745. PMID 8555498

Див. також

• Хромосома 2