SP4

SP4
Ідентифікатори
Символи	SP4, HF1B, SPR-1, Sp4 transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 600540 MGI: 107595 HomoloGene: 2341 GeneCards: SP4
Пов'язані генетичні захворювання
великий депресивний розлад, unipolar depression
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1950094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6671	20688
Ensembl	ENSG00000105866	ENSMUSG00000025323
UniProt	Q02446	Q62445
RefSeq (мРНК)	NM_003112 NM_001326542 NM_001326543	NM_001166385 NM_009239
RefSeq (білок)	NP_001313471 NP_001313472 NP_003103	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 7: 21.43 – 21.51 Mb	Хр. 12: 118.2 – 118.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SP4 (англ. Sp4 transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 784 амінокислот, а молекулярна маса — 81 985.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDQKKEEEE		EAAAAAAMAT		EGGKTSEPEN		NNKKPKTSGS		QDSQPSPLAL
LAATCSKIGT		PGENQATGQQ		QIIIDPSQGL		VQLQNQPQQL		ELVTTQLAGN
AWQLVASTPP		ASKENNVSQP		ASSSSSSSSS		NNGSASPTKT		KSGNSSTPGQ
FQVIQVQNPS		GSVQYQVIPQ		LQTVEGQQIQ		INPTSSSSLQ		DLQGQIQLIS
AGNNQAILTA		ANRTASGNIL		AQNLANQTVP		VQIRPGVSIP		LQLQTLPGTQ
AQVVTTLPIN		IGGVTLALPV		INNVAAGGGT		GQVGQPAATA		DSGTSNGNQL
VSTPTNTTTS		ASTMPESPSS		STTCTTTAST		SLTSSDTLVS		SADTGQYAST
SASSSERTIE		ESQTPAATES		EAQSSSQLQP		NGMQNAQDQS		NSLQQVQIVG
QPILQQIQIQ		QPQQQIIQAI		PPQSFQLQSG		QTIQTIQQQP		LQNVQLQAVN
PTQVLIRAPT		LTPSGQISWQ		TVQVQNIQSL		SNLQVQNAGL		SQQLTITPVS
SSGGTTLAQI		APVAVAGAPI		TLNTAQLASV		PNLQTVSVAN		LGAAGVQVQG
VPVTITSVAG		QQQGQDGVKV		QQATIAPVTV		AVGGIANATI		GAVSPDQLTQ
VHLQQGQQTS		DQEVQPGKRL		RRVACSCPNC		REGEGRGSNE		PGKKKQHICH
IEGCGKVYGK		TSHLRAHLRW		HTGERPFICN		WMFCGKRFTR		SDELQRHRRT
HTGEKRFECP		ECSKRFMRSD		HLSKHVKTHQ		NKKGGGTALA		IVTSGELDSS
VTEVLGSPRI		VTVAAISQDS		NPATPNVSTN		MEEF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Hagen G., Mueller S., Beato M., Suske G. (1992). Cloning by recognition site screening of two novel GT box binding proteins: a family of Sp1 related genes. Nucleic Acids Res. 20: 5519—5525. PMID 1454515 DOI:10.1093/nar/20.21.5519
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7