Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MNX1
Ідентифікатори
Символи
MNX1 , HB9, HLXB9, HOXHB9, SCRA1, motor neuron and pancreas homeobox 1
Зовнішні ІД
OMIM : 142994 MGI: 109160 HomoloGene: 21137 GeneCards: MNX1
Пов'язані генетичні захворювання
Currarino syndrome [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1950094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • humoral immune response • neuron projection morphogenesis • spinal cord motor neuron cell fate specification • transcription, DNA-templated • anatomical structure morphogenesis • endocrine pancreas development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 156.99 – 157.01 Mb
Хр. 5: 29.68 – 29.68 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
MNX1 (англ. Motor neuron and pancreas homeobox 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 401 амінокислот , а молекулярна маса — 40 569[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEKSKNFRID ALLAVDPPRA ASAQSAPLAL VTSLAAAASG TGGGGGGGGA
SGGTSGSCSP ASSEPPAAPA DRLRAESPSP PRLLAAHCAL LPKPGFLGAG
GGGGGTGGGH GGPHHHAHPG AAAAAAAAAA AAAAGGLALG LHPGGAQGGA
GLPAQAALYG HPVYGYSAAA AAAALAGQHP ALSYSYPQVQ GAHPAHPADP
IKLGAGTFQL DQWLRASTAG MILPKMPDFN SQAQSNLLGK CRRPRTAFTS
QQLLELEHQF KLNKYLSRPK RFEVATSLML TETQVKIWFQ NRRMKWKRSK
KAKEQAAQEA EKQKGGGGGA GKGGAEEPGA EELLGPPAPG DKGSGRRLRD
LRDSDPEEDE DEDDEDHFPY SNGASVHAAS SDCSSEDDSP PPRPSHQPAP
Q
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , ацетилювання, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Harrison K.A., Druey K.M., Deguchi Y., Tuscano J.M., Kehrl J.H. (1994). A novel human homeobox gene distantly related to proboscipedia is expressed in lymphoid and pancreatic tissues. J. Biol. Chem . 269 : 19968—19975. PMID 7914194
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші