HLA-DRB1

HLA-DRB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1A6A, 1BX2, 1YMM, 2WBJ,%%s1AQD, 1DLH, 1FYT, 1HXY, 1JWM, 1JWS, 1JWU, 1KG0, 1KLG, 1KLU, 1LO5, 1PYW, 1R5I, 1SEB, 1SJH, 1T5W, 1T5X, 2FSE, 2G9H, 2IAM, 2IAN, 2ICW, 2IPK, 2OJE, 2XN9, 3L6F, 3PDO, 3PGC, 3PGD, 3QXA, 3QXD, 3S4S, 3S5L, 4AEN, 4AH2, 4C56, 4E41, 4FQX, 4GBX, 4I5B, 4OV5, 4X5W, 4X5X,%%s1D5M, 1D5X, 1D5Z, 1D6E, 1J8H, 2SEB, 3O6F, 3T0E, 4IS6, 4MCY, 4MCZ, 4MD0, 4MD4, 4MD5, 4MDI, 4MDJ, 4Y19, 4Y1A
Ідентифікатори
Символи	HLA-DRB1, DRB1, DRw10, HLA-DR1B, HLA-DRB, SS1, major histocompatibility complex, class II, DR beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 142857 MGI: 95901 HomoloGene: 136635 GeneCards: HLA-DRB1
Онтологія гена Молекулярна функція • peptide antigen binding • MHC class II receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • MHC class II protein complex binding Клітинна компонента • integral component of membrane • endocytic vesicle membrane • clathrin-coated endocytic vesicle membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • trans-Golgi network membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • late endosome membrane • Golgi membrane • клітинна мембрана • transport vesicle membrane • MHC class II protein complex • lysosomal membrane • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • лізосома • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • endosome membrane • external side of plasma membrane • cell surface • екзосома Біологічний процес • antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • процес імунної системи • interferon-gamma-mediated signaling pathway • immunoglobulin production involved in immunoglobulin-mediated immune response • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • peptide antigen assembly with MHC class II protein complex • T cell receptor signaling pathway • адаптивна імунна відповідь • negative regulation of interferon-gamma production • inflammatory response to antigenic stimulus • protein tetramerization • regulation of interleukin-4 production • negative regulation of T cell proliferation • T-helper 1 type immune response • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • T cell costimulation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3123	14969
Ensembl	ENSG00000236884 ENSG00000206240 ENSG00000229074 ENSG00000196126 ENSG00000206306 ENSG00000228080	ENSMUSG00000060586
UniProt	P01911	P04231 P04230 P18468 P18469 O78196 н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001243965 NM_002124 NM_001359193 NM_001359194	NM_010382
RefSeq (білок)	NP_001230894 NP_002115 NP_001346122 NP_001346123 NP_002115.2	NP_034512
Локус (UCSC)	Хр. 6: 32.58 – 32.59 Mb	Хр. 17: 34.52 – 34.54 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HLA-DRB1 (англ. HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-15 beta chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 266 амінокислот, а молекулярна маса — 29 966.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVCLKLPGGS		CMTALTVTLM		VLSSPLALSG		DTRPRFLWQP		KRECHFFNGT
ERVRFLDRYF		YNQEESVRFD		SDVGEFRAVT		ELGRPDAEYW		NSQKDILEQA
RAAVDTYCRH		NYGVVESFTV		QRRVQPKVTV		YPSKTQPLQH		HNLLVCSVSG
FYPGSIEVRW		FLNGQEEKAG		MVSTGLIQNG		DWTFQTLVML		ETVPRSGEVY
TCQVEHPSVT		SPLTVEWRAR		SESAQSKMLS		GVGGFVLGLL		FLGAGLFIYF
RNQKGHSGLQ		PTGFLS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• Lock C.B., So A.K., Welsh K.I., Parkes J.D., Trowsdale J. (1988). MHC class II sequences of an HLA-DR2 narcoleptic. Immunogenetics. 27: 449—455. PMID 3259543 DOI:10.1007/BF00364432
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee B.S.M., Rust N.A., McMichael A.J., McDevitt H.O. (1987). HLA-DR2 subtypes form an additional supertypic family of DR beta alleles. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 4591—4595. PMID 2885840 DOI:10.1073/pnas.84.13.4591
• Cresswell P. (1996). Invariant chain structure and MHC class II function. Cell. 84: 505—507. PMID 8598037 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81025-9
• Villadangos J.A. (2001). Presentation of antigens by MHC class II molecules: getting the most out of them. Mol. Immunol. 38: 329—346. PMID 11684289 DOI:10.1016/S0161-5890(01)00069-4
• Menendez-Benito V., Neefjes J. (2007). Autophagy in MHC class II presentation: sampling from within. Immunity. 26: 1—3. PMID 17241953 DOI:10.1016/j.immuni.2007.01.005

Див. також

• Хромосома 6