Бета-ланцюг тубуліну

Бета-ланцюг тубуліну
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3QNZ, 3QO0
Ідентифікатори
Символи	TUBB, CDCBM6, M40, OK/SW-cl.56, TUBB1, TUBB5, CSCSC1, tubulin beta class I
Зовнішні ІД	OMIM: 191130 MGI: 107812 HomoloGene: 69099 GeneCards: TUBB
Пов'язані генетичні захворювання
	complex cortical dysplasia with other brain malformations 6
Реагує на сполуку
	кабазитаксел, доцетаксел, eribulin, ixabepilone, паклітаксел, вінкристин, velban
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GTPase activating protein binding; • nucleotide binding; • protein domain specific binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • GTP binding; • structural molecule activity; • structural constituent of cytoskeleton; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0006184 GTPase activity; • MHC class I protein binding; • ubiquitin protein ligase binding;
Клітинна компонента	• cell body; • extracellular region; • nuclear envelope lumen; • cytoplasmic ribonucleoprotein granule; • екзосома; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • мікротрубочка; • цитоскелет; • клітинне ядро; • microtubule cytoskeleton; • azurophil granule lumen; • цитоплазма; • membrane raft; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• cytoskeleton-dependent intracellular transport; • spindle assembly; • поділ клітини; • G2/M transition of mitotic cell cycle; • GO:0006928 клітинний процес; • natural killer cell mediated cytotoxicity; • microtubule-based process; • neutrophil degranulation; • ciliary basal body-plasma membrane docking; • regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; • microtubule cytoskeleton organization; • GO:0007067 мітоз; • GO:1904739 regulation of synapse organization; • cytoskeleton organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	203068
	22154
ENSG00000196230; ENSG00000232421; ENSG00000183311; ENSG00000224156; ENSG00000235067;
	ENSG00000232575; ENSG00000227739; ENSG00000229684
	ENSMUSG00000001525
	P07437; Q5SU16
	P99024
NM_001293212; NM_001293213; NM_001293214; NM_001293215; NM_001293216;
	NM_178014
	NM_011655
NP_001280141; NP_001280142; NP_001280143; NP_001280144; NP_001280145;
	NP_821133; NP_821133.1
	NP_035785
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Бета-ланцюг тубуліну (англ. Tubulin beta class I) – білок, який кодується геном TUBB, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 444 амінокислот, а молекулярна маса — 49 671^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MREIVHIQAG	QCGNQIGAKF	WEVISDEHGI	DPTGTYHGDS	DLQLDRISVY
YNEATGGKYV	PRAILVDLEP	GTMDSVRSGP	FGQIFRPDNF	VFGQSGAGNN
WAKGHYTEGA	ELVDSVLDVV	RKEAESCDCL	QGFQLTHSLG	GGTGSGMGTL
LISKIREEYP	DRIMNTFSVV	PSPKVSDTVV	EPYNATLSVH	QLVENTDETY
CIDNEALYDI	CFRTLKLTTP	TYGDLNHLVS	ATMSGVTTCL	RFPGQLNADL
RKLAVNMVPF	PRLHFFMPGF	APLTSRGSQQ	YRALTVPELT	QQVFDAKNMM
AACDPRHGRY	LTVAAVFRGR	MSMKEVDEQM	LNVQNKNSSY	FVEWIPNNVK
TAVCDIPPRG	LKMAVTFIGN	STAIQELFKR	ISEQFTAMFR	RKAFLHWYTG
EGMDEMEFTE	AESNMNDLVS	EYQQYQDATA	EEEEDFGEEA	EEEA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Lee M.G.-S., Lewis S.A., Wilde C.D., Cowan N.J. (1983). Evolutionary history of a multigene family: an expressed human beta-tubulin gene and three processed pseudogenes. Cell. 33: 477—487. PMID 6688039 DOI:10.1016/0092-8674(83)90429-4
Hall J.L., Dudley L., Dobner P.R., Lewis S.A., Cowan N.J. (1983). Identification of two human beta-tubulin isotypes. Mol. Cell. Biol. 3: 854—862. PMID 6868634 DOI:10.1128/MCB.3.5.854
Crabtree D.V., Ojima I., Geng X., Adler A.J. (2001). Tubulins in the primate retina: evidence that xanthophylls may be endogenous ligands for the paclitaxel-binding site. Bioorg. Med. Chem. 9: 1967—1976. PMID 11504633 DOI:10.1016/S0968-0896(01)00103-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Li D., Dammer E.B., Lucki N.C., Sewer M.B. (2013). cAMP-stimulated phosphorylation of diaphanous 1 regulates protein stability and interaction with binding partners in adrenocortical cells. Mol. Biol. Cell. 24: 848—857. PMID 23325789 DOI:10.1091/mbc.E12-08-0597
Valenstein M.L., Roll-Mecak A. (2016). Graded control of microtubule severing by tubulin glutamylation. Cell. 164: 911—921. PMID 26875866 DOI:10.1016/j.cell.2016.01.019

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з Бета-ланцюг тубуліну переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Tubulin beta class I переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20778 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 30 січня 2017. [Архівовано 2017-05-28 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P07437 (англ.) . Архів оригіналу за 26 грудня 2016. Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з Бета-ланцюг тубуліну переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Tubulin beta class I переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20778 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 30 січня 2017. [Архівовано 2017-05-28 у Wayback Machine.]

[UniProt-6] UniProt, P07437 (англ.) . Архів оригіналу за 26 грудня 2016. Процитовано 30 січня 2017.

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]