AMY1B

AMY1B (англ. Amylase, alpha 1C (salivary)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 511 амінокислот, а молекулярна маса — 57 768.

AMY1B
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1C8Q, 1JXJ, 1JXK, 1MFU, 1MFV, 1NM9, 1Q4N, 1SMD, 1XV8, 1Z32, 3BLK, 3BLP, 3DHP
Ідентифікатори
Символи	AMY1B, AMY1, amylase, alpha 1B (salivary), amylase alpha 1B (salivary), amylase alpha 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 104701 HomoloGene: 133998 GeneCards: AMY1B
шифр КФ	3.2.1.1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0103025 alpha-amylase activity • hydrolase activity • каталітична активність • зв'язування з іоном металу • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds • cation binding Клітинна компонента • extracellular region • екзосома • міжклітинний простір Біологічний процес • травлення • обмін речовин • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	277	н/д
Ensembl	ENSG00000174876	н/д
UniProt	P04745 Q5T085	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001008218 NM_001386925	н/д
RefSeq (білок)	NP_001008220 NP_001333709 NP_001008222 NP_004029 NP_001008219	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 103.69 – 103.7 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKLFWLLFTI		GFCWAQYSSN		TQQGRTSIVH		LFEWRWVDIA		LECERYLAPK
GFGGVQVSPP		NENVAIHNPF		RPWWERYQPV		SYKLCTRSGN		EDEFRNMVTR
CNNVGVRIYV		DAVINHMCGN		AVSAGTSSTC		GSYFNPGSRD		FPAVPYSGWD
FNDGKCKTGS		GDIENYNDAT		QVRDCRLSGL		LDLALGKDYV		RSKIAEYMNH
LIDIGVAGFR		IDASKHMWPG		DIKAILDKLH		NLNSNWFPEG		SKPFIYQEVI
DLGGEPIKSS		DYFGNGRVTE		FKYGAKLGTV		IRKWNGEKMS		YLKNWGEGWG
FMPSDRALVF		VDNHDNQRGH		GAGGASILTF		WDARLYKMAV		GFMLAHPYGF
TRVMSSYRWP		RYFENGKDVN		DWVGPPNDNG		VTKEVTINPD		TTCGNDWVCE
HRWRQIRNMV		NFRNVVDGQP		FTNWYDNGSN		QVAFGRGNRG		FIVFNNDDWT
FSLTLQTGLP		AGTYCDVISG		DKINGNCTGI		KIYVSDDGKA		HFSISNSAED
PFIAIHAESK		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, глікозидаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як вуглеводний обмін. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, хлоридом. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gumucio D.L., Wiebauer K., Caldwell R.M., Samuelson L.C., Meisler M.H. (1988). Concerted evolution of human amylase genes. Mol. Cell. Biol. 8: 1197—1205. PMID 2452973 DOI:10.1128/MCB.8.3.1197
• Bank R.A., Hettema E.H., Arwert F., Amerongen A.V., Pronk J.C. (1991). Electrophoretic characterization of posttranslational modifications of human parotid salivary alpha-amylase. Electrophoresis. 12: 74—79. PMID 1710976 DOI:10.1002/elps.1150120114
• Ramasubbu N., Paloth V., Luo Y., Brayer G.D., Levine M.J. (1996). Structure of human salivary alpha-amylase at 1.6-A resolution: implications for its role in the oral cavity. Acta Crystallogr. D. 52: 435—446. PMID 15299664 DOI:10.1107/S0907444995014119
• Ramasubbu N., Ragunath C., Mishra P.J. (2003). Probing the role of a mobile loop in substrate binding and enzyme activity of human salivary amylase. J. Mol. Biol. 325: 1061—1076. PMID 12527308 DOI:10.1016/S0022-2836(02)01326-8
• Handy D.E., Larsen S.H., Karn R.C., Hodes M.E. (1987). Identification of a human salivary amylase gene. Partial sequence of genomic DNA suggests a mode of regulation different from that of mouse, Amy1. Mol. Biol. Med. 4: 145—155. PMID 2442579

Див. також

• Хромосома 1