Şablon:Protein ailesi bilgi kutusu
Protein ailesi bilgi kutusu | |
---|---|
Tanımlayıcılar | |
Sembol | ? |
Bu şablon şu Lua modüllerini kullanıyor: |
Bu şablon, Pfam gibi biyolojik veri tabanlarında tanımlandığı şekliyle bir protein ailesi/alanı için şablondur.
Kullanım
[kaynağı değiştir]Bu şablonu kullanmak için aşağıdaki metni kopyalayın ve maddenizin en üstüne yapıştırın. Mümkün olduğunca çok alanı doldurun, ancak bazı bilgiler eksikse endişelenmeyin.
{{Protein ailesi bilgi kutusu
| sınıf = <!-- yer kazanmak için: mw-collapsible mw-collapsed -->
| Sembol =
| Ad =
| resim =
| altyazı =
| Pfam =
| Pfam_clan =
| InterPro =
| SMART =
| PROSITE =
| MEROPS =
| CATH =
| SCOP =
| TCDB =
| OPM ailesi = <!-- aslında OPM süper ailesi. SADECE protein ailesi tam bir "süperaile" eşleşmesine sahip olduğunda yazın! -->
| OPM protein =
| CAZy =
| CDD =
| Membranome süperailesi = <!-- yukarıdakiyle aynı: yalnızca tam eşleşme olduğunda. -->
| Membranome ailesi =
}}
Örnekler
[kaynağı değiştir]Aşağıdaki doldurulmuş Pfam bilgi kutusu şablonu sağdaki bilgi kutusunu üretir.
Ligand-binding domain (LBD) | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Tanımlayıcılar | |||||||||
Sembol | Hormone_recep | ||||||||
Pfam | PF00104 | ||||||||
InterPro | IPR000536 | ||||||||
SMART | SM00430 | ||||||||
CATH | 1lbd | ||||||||
SCOP2 | 1lbd / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
CDD | cd06157 | ||||||||
|
{{Protein ailesi bilgi kutusu
| Sembol = Hormone_recep
| sınıf = collapsible
| Ad = Ligand-binding domain (LBD)
| resim = RORC_3L0L.png
| caption = [[RAR ile ilişkili yetim reseptör gama|RORγ]] ({{PDB|3L0L}})
| Pfam = PF00104
| InterPro = IPR000536
| SMART = SM00430
| PROSITE =
| SCOP = 1lbd
| CATH = 1lbd
| TCDB =
| OPM ailesi =
| OPM proteini =
| CDD = cd06157
}}
Bakım
[kaynağı değiştir]TemplateData
[kaynağı değiştir]Protein ailesi bilgi kutusu için şablon verileri
Bu, Pfam gibi biyolojik veri tabanlarında tanımlanan bir protein ailesi/alanı için şablondur.
Parametre | Açıklama | Tür | Durum | |
---|---|---|---|---|
Sembol | Sembol | açıklama yok | Satır | isteğe bağlı |
Ad | Ad | açıklama yok | Satır | isteğe bağlı |
resim | resim | izleme kategorisini bastırmak için gerekli değilse "NONE" olarak doldurun | Dosya | isteğe bağlı |
Genişlik | genişlik | Görüntü için genişlik | Dize | isteğe bağlı |
Altyazı | altyazı | Resim için altyazı | Dize | isteğe bağlı |
InterPro aile tanımlayıcısı | InterPro | açıklama yok | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
Pfam aile tanımlayıcısı | Pfam | Pfam aile kaydına otomatik bağlantı | Satır | isteğe bağlı |
Pfam klanı tanımlayıcısı | Pfam_klanı | Pfam klan kaydına otomatik bağlantılar; bir klan, ilişkili ailelerden oluşan bir gruptur (~üst aile). | Satır | isteğe bağlı |
Interpro tanımlayıcısı | Interpro | Interpro girişine otomatik bağlantı | Satır | isteğe bağlı |
SMART erişim numarası | SMART | Basit Modüler Mimari Araştırma Aracı'ndaki bir alan adı girişine otomatik bağlantı | Satır | isteğe bağlı |
PROSITE kayıt tanımlayıcısı | PROSITE | PROSITE kayıt aramasına otomatik bağlantı | Satır | isteğe bağlı |
MEROPS kayıt tanımlayıcısı | MEROPS | MEROPS kaydına otomatik bağlantı (MEROPS peptidazlara ve inhibitörlerine kapsamlıdır) | Satır | isteğe bağlı |
SCOP (alan/PDB erişim numarası) | SCOP | Bir PDB erişim numarası veya SCOP alan adı verildiğinde, bir SCOP ve bir SUPFAM sayfasına otomatik bağlantı verir. | Satır | isteğe bağlı |
SCOP2 geçersiz kılma | SCOP2 | SCOP ve SCOP2 farklı etki alanı isimlendirmesi kullanır. SCOP için bir etki alanı belirtilmişse bu değeri kullanın.
| Bilinmiyor | isteğe bağlı |
CATH (alan/PDB erişim numarası) | CATH | Bir CATH etki alanı kimliği veya PDB erişim numarası verildiğinde, CATH'ye (Protein Yapısal Etki Alanlarının Sınıflandırılması) otomatik bağlantı verir. | Satır | isteğe bağlı |
TCDB tanımlayıcısı | TCDB | Taşıyıcı Sınıflandırma Veritabanı'nda bir tanımlayıcı aramasına otomatik bağlantı | Satır | isteğe bağlı |
OPM süperaile tanımlayıcısı | OPM ailesi | Membranlardaki Proteinlerin Yönelimleri veritabanındaki bir süperaile kaydına otomatik bağlantılar. | Satır | isteğe bağlı |
OPM proteini tanımlayıcısı | OPM proteini | Değer tipik olarak bir PDB tanımlayıcısı olacaktır; Membranlardaki Proteinlerin Yönelimleri veritabanındaki bir protein kaydına otomatik bağlantı verir | Satır | isteğe bağlı |
CAZy aile tanımlayıcısı | CAZy | Karbonhidrat-Aktif enzimler veritabanındaki bir aile tanım sayfasına otomatik bağlantı verir. | Satır | isteğe bağlı |
CDD uid | CDD | Korunan Etki Alanı Veritabanındaki bir kayda otomatik bağlantı | Satır | isteğe bağlı |
align | align | açıklama yok | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
resim_boyutu | resim_boyutu | açıklama yok | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
alt | alt | açıklama yok | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
Membranome süperailesi | Membranome süperailesi | açıklama yok | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
Membranome ailesi | Membranome ailesi | açıklama yok | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
sınıf | sınıf | bilgi kutusu sınıfı
| Bilinmiyor | isteğe bağlı |
aşağı | aşağı | dipnotlar | Bilinmiyor | isteğe bağlı |
PDB | PDB | PDB örnekleri. Yalnızca şu durumlarda kullanın: görüntü yok, CATH/SCOP örneği yok, InterPro veya PDB araması başarısız. | İçerik | kaldırıldı |