POLR2J2
| Полипептид J2 РНК-полимеразы II (управляемой ДНК) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | POLR2J2 ; HRPB11B; RPB11b1 | ||||||||||
| Внешние ID | OMIM: 609881 HomoloGene: 129653 GeneCards: Ген POLR2J2 | ||||||||||
| |||||||||||
| Профиль экспрессии РНК | |||||||||||
 | |||||||||||
| Больше информации | |||||||||||
| Ортологи | |||||||||||
| Вид | Человек | Мышь | |||||||||
| Entrez | 246721 | n/a | |||||||||
| Ensembl | ENSG00000168255 | n/a | |||||||||
| UniProt | Q9GZM3 | n/a | |||||||||
| RefSeq (мРНК) | NM_032958 | n/a | |||||||||
| RefSeq (белок) | NP_116581 | n/a | |||||||||
| Локус (UCSC) | Chr 7: 102.18 – 102.21 Mb |
n/a | |||||||||
| Поиск в PubMed | Искать | n/a | |||||||||
J-связанный ген полипептида ДНК-зависимой РНК-полимеразы II, известный также как POLR2J2 — это ген человека[1].
Этот ген представляет собой семейство генов 11-й субъединицы РНК-полимеразы II, которое включает в себя три гена в кластере на хромосоме 7q22.1 и псевдоген на хромосоме 7p13. Один из членов этого семейства, ДНК-зависимой РНК-полимеразы II полипептид J, как было выявлено, кодирует субъединицу РНК-полимеразы II, ответственной за синтез матричной РНК у эукариот. Этот локус производит множество вариантов альтернативных сплайсинга, которые потенциально представляют собой изоформы с отличными от полипептида J С-концами. Большинство вариантов сплайсинга включают дополнительные некодированные экзоны на 3'-конце, что делает их кандидатами на нонсенс-опосредованный распад. Следовательно, не известно, этот ли локус экспрессирует белок или белки в естественных условиях[1].
Примечания
[править | править код]Литература
[править | править код]- Shpakovskii D.G., Shematorova E.K., Shpakovskii G.V. Human PMS2 gene family: origin, molecular evolution, and biological implications (англ.) // Dokl. Biochem. Biophys. : journal. — 2006. — Vol. 408. — P. 175—179. — doi:10.1134/S1607672906030185. — PMID 16913423.
- Benga WJ; Grandemange S; Shpakovski GV; Shematorova, EK; Kedinger, C; Vigneron, M. Distinct regions of RPB11 are required for heterodimerization with RPB3 in human and yeast RNA polymerase II (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 2005. — Vol. 33, no. 11. — P. 3582—3590. — doi:10.1093/nar/gki672. — PMID 15987790. — PMC 1159119.
- Shpakovskiĭ D.G., Shematorova E.K., Shpakovskiĭ G.V. [New genes on human chromosome 7: bioinformatic analysis of a gene cluster from the POLR2J family] (англ.) // Bioorg. Khim. : journal. — 2005. — Vol. 30, no. 6. — P. 621—625. — PMID 15586814.
- Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, G.D. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Durrin L.K., Krontiris T.G. The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2002. — Vol. 79, no. 6. — P. 809—817. — doi:10.1006/geno.2002.6772. — PMID 12036295.
- Grandemange S; Schaller S; Yamano S; Du Manoir, Stanislas; Shpakovski, George V; Mattei, Marie-Geneviève; Kedinger, Claude; Vigneron, Marc. A human RNA polymerase II subunit is encoded by a recently generated multigene family (англ.) // BMC Mol. Biol. : journal. — 2003. — Vol. 2. — P. 14. — doi:10.1186/1471-2199-2-14. — PMID 11747469. — PMC 61041.
- Cramer P; Bushnell DA; Fu J; Gnatt, AL; Maier-Davis, B; Thompson, NE; Burgess, RR; Edwards, AM; David, P.R. Architecture of RNA polymerase II and implications for the transcription mechanism (англ.) // Science : journal. — 2000. — Vol. 288, no. 5466. — P. 640—649. — doi:10.1126/science.288.5466.640. — PMID 10784442.
- Toward a complete human genome sequence (англ.) // Genome Research : journal. — 1999. — Vol. 8, no. 11. — P. 1097—1108. — doi:10.1101/gr.8.11.1097. — PMID 9847074.