Шаблон:Семейство белков

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Семейство белков
Документация

Это шаблон для семейств белков/доменов as defined in biological databases such as Pfam.

Использование

[править код]

To use this template, copy the following text and paste it at the top of your article. Fill in as many fields as possible, but don't worry if some information is missing.

{{Семейство белков
| Symbol      = 
| Name        = 
| image       = 
| width       = 
| caption     = 
| Pfam        = 
| Pfam_clan   = 
| InterPro    = 
| SMART       = 
| PROSITE     = 
| MEROPS      = 
| SCOP        = 
| TCDB        = 
| OPM family  = 
| OPM protein = 
| CAZy        = 
| CDD         = 
}}

Пример

[править код]

Заполнение данной таблици генерирует следующий шаблон: см. справа

Ligand-binding domain (LBD)
RORγ
RORγ
Идентификаторы
Символ Hormone_recep
Pfam PF00104
InterPro IPR000536
SMART SM00430
SCOP 1lbd
SUPERFAMILY 1lbd
CDD cd06157
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель
{{Infobox protein family
| Symbol      = Hormone_recep
| Name        = Ligand-binding domain (LBD)
| image       = RORC_3L0L.png
| width       = 
| caption     = [[RAR-related orphan receptor gamma|RORγ]]
| Pfam        = PF00104
| InterPro    = IPR000536
| SMART       = SM00430
| PROSITE     = 
| SCOP        = 1lbd
| TCDB        = 
| OPM family  = 
| OPM protein = 
| CDD         = cd06157
}}

Параметры шаблона

[править код]

This is template for a protein family/domain as defined in biological databases such as Pfam.

Параметры шаблона[Править данные шаблона]

Шаблон использует блочное форматирование параметров.

ПараметрОписаниеТипСтатус
SymbolSymbol

без описания

Однострочныйнеобязательный
NameName

имя

Однострочныйнеобязательный
Imageimage

имя файла

Имя страницынеобязательный
Widthwidth

Ширина картинки

Строковый (без форматирования)необязательный
Captioncaption

подпись под картинкой

Строковый (без форматирования)необязательный
Pfam family identifierPfam

Автоматические ссылки на записи Pfam

Однострочныйнеобязательный
Pfam clan identifierPfam_clan

Автоматические ссылки на клановые записи Pfam;клан -группа родственных белковых семей.

Однострочныйнеобязательный
Interpro identifierInterpro

Автоматические ссылки на статью в Interpro

Однострочныйнеобязательный
SMART accession numberSMART

Автоматические ссылки на информацию о домене в Simple Modular Architecture Research Tool

Однострочныйнеобязательный
PROSITE record identifierPROSITE

Автоматические ссылки на поиск PROSITE

Однострочныйнеобязательный
MEROPS record identifierMEROPS

Автоматические ссылки на записи MEROPS (MEROPS описание пептидаз и их ингибиторов)

Однострочныйнеобязательный
SCOP (PDB accession number)SCOP

Given a PDB accession number, auto-links to a SCOP (Structural Classification of Proteins) family level page. Also generates an auto-link to a SCOP SUPERFAMILY record.

Однострочныйнеобязательный
TCDB identifierTCDB

Автоматические ссылки на поиск идентификаторов в Transporter Classification Database

Однострочныйнеобязательный
OPM superfamily identifierOPM family

Автоматические ссылки на описание белка в Orientations of Proteins in Membranes

Однострочныйнеобязательный
OPM protein identifierOPM protein

значение идентификатора PDB; Автоматические ссылки на описание белка в Orientations of Proteins in Membranes

Однострочныйнеобязательный
CAZy family identifierCAZy

Ссылка на описание семейства в Carbohydrate-Active enZYmes.

Однострочныйнеобязательный
CDD uidCDD

Ссылка на Conserved Domain Database

Однострочныйнеобязательный