Супероксиддисмутаза (СОД, КФ 1.15.1.1) относится к группе антиоксидантных ферментов. Вместе с каталазой и другими антиоксидантными ферментами она защищает организм человека от постоянно образующихся высокотоксичных кислородных радикалов. Супероксиддисмутаза катализирует дисмутацию супероксида в кислород и пероксид водорода. Таким образом, она играет важнейшую роль в антиоксидантной защите практически всех клеток, так или иначе находящихся в контакте с кислородом. Одним из редких исключений является молочнокислая бактерия Lactiplantibacillus plantarum и родственные ей молочнокислые бактерии, использующие иной механизм защиты от образующегося супероксида.
| супероксиддисмутаза 1, цитозольная | |
|---|---|
 | |
| Обозначения | |
| Символы | SOD1; ALS, ALS1 |
| CAS | 9054-89-1 |
| Entrez Gene | 6647 |
| HGNC | 11179 |
| OMIM | 147450 |
| RefSeq | NM_000454 |
| UniProt | P00441 |
| Другие данные | |
| Шифр КФ | 1.15.1.1 |
| Локус | 21-я хр. , 21q22.1 |
 Информация в Викиданных ? | |
| супероксиддисмутаза 2, митохондриальная | |
|---|---|
| | |
| Обозначения | |
| Символы | SOD2 |
| CAS | 9054-89-1 |
| Entrez Gene | 6648 |
| HGNC | 11180 |
| OMIM | 147460 |
| RefSeq | NM_000636 |
| UniProt | P04179 |
| Другие данные | |
| Шифр КФ | 1.15.1.1 |
| Локус | 6-я хр. , 6q25 |
| Информация в Викиданных ? | |
| супероксиддисмутаза 3, внеклеточная | |
|---|---|
| | |
| Обозначения | |
| Символы | SOD3 |
| CAS | 9054-89-1 |
| Entrez Gene | 6649 |
| HGNC | 11181 |
| OMIM | 185490 |
| RefSeq | NM_003102 |
| UniProt | P08294 |
| Другие данные | |
| Шифр КФ | 1.15.1.1 |
| Локус | 4-я хр. , 4 pter-q21 |
| Информация в Викиданных ? | |
Реакция
правитьРеакцию дисмутации супероксида, катализируемую супероксиддисмутазой, можно разбить на две части (парциальные реакции) следующим образом:
- M(n 1) − СОД O2− → Mn − СОД O2
- Mn − СОД O2− 2H → M(n 1) − СОД H2O2.
где M (переходный металл) = Cu (n=1) ; Mn (n=2) ; Fe (n=2) ; Ni (n=2).
В данной реакции окислительное состояние катиона металла осцилирует между n и n 1.
Типы
правитьВведение
правитьСуществует несколько форм супероксиддисмутазы в зависимости от типа переходного металла-кофактора активного центра фермента: Cu,Zn-СОД (медь как кофактор активного центра и цинк как кофактор, стабилизирующий конформацию), Mn-СОД (с марганцем в активном центре), а также менее распространённые Fe-СОД (с железом)) и Ni-СОД (с никелем).
- Цитозоль практически всех эукариотических клеток содержит супероксиддисмутазу типа Cu,Zn-СОД. Это самая распространённая супероксиддисмутаза и единственная коммерчески доступная форма фермента (как правило выделенная либо из эритроцитов, либо из печени быка: PDB 1SXA Архивная копия от 29 марта 2008 на Wayback Machine, EC 1.15.1.1). Cu,Zn-СОД является гомодимером (то есть состоящим из двух одинаковых субъединиц), молекулярная масса 32,5 кДа. Субъединицы белка связаны друг с другом в первую очередь гидрофобными и электростатическими связями. Медь и цинк связаны с белковой частью молекулы через гистидиновые остатки.
- Митохондрии эукариотических клеток и многие бактерии содержат супероксиддисмутазу с Mn (Mn-СОД). Например, митохондриальная СОД человека: PDB 1N0J (недоступная ссылка), EC 1.15.1.1, молекулярная масса 86-88 кДа. Марганец в этом ферменте координирован с белком через 3 гистидина и аспартат и с водой либо гидроксильным лигандом в зависимости от окислительного состояния Mn (Mn(II) или Mn(III)).
- E. coli и многие другие бактерии содержат формы фермента с железом (Fe-СОД), другие — с марганцем (Mn-СОД), а некоторые — оба эти типа. (E. coli Fe-SOD: PDB 1ISA Архивная копия от 29 марта 2008 на Wayback Machine, EC 1.15.1.1). Активные центры Mn- и Fe-СОД содержат те же аминокислоты в боковых цепях.
Человек
правитьВ организме человека существует три типа СОД. СОД1 находится в цитоплазме, СОД2 — в митохондрии, а СОД3 — это внеклеточная (экстраклеточная) форма. Первая форма — димерная, тогда как вторая и третья формы — тетрамерные (состоящие из 4 равных субъединиц). СОД1 и СОД3 содержат медь в активном центре и цинк как структурный компонент, а СОД2 содержит марганец в активном центре. Гены этих форм локализуются соответственно в хромосомах 21, 6 и 4 (21q22.1, 6q25.3 и 4p15.3-p15.1). Цитозольная СОД1 является небольшим белком с молекулярной массой 32,5 кДа, молекулярная масса митохондриальной СОД2 — около 86-88 кДа. Экстраклеточная СОД3 представляет собой самую крупную супероксиддисмутазу, молекулярная масса — 135 кДа.
Биохимия
правитьСупероксидный радикал (O2−) спонтанно довольно быстро дисмутирует в кислород O2 и пероксид водорода H2O2 (~105 M−1 s−1 при pH 7). Тем не менее, супероксид ещё быстрее реагирует с некоторыми другими молекулами-мишенями, такими как оксид азота NO, образуя при этом пероксинитрит. Однако супероксиддисмутаза обладает самой высокой известной каталитической скоростью реакции (~109 M−1 s−1). Реакция лимитирована только частотой столкновения супероксида с ферментом (т. н. диффузионно-лимитированная реакция), благодаря чему супероксиддисмутаза защищает клетку от повреждающего действия супероксида.
Физиология
правитьСупероксид является одним из основных прооксидантов в клетке, поэтому СОД играет одну из ключевых ролей в антиоксидантной защите организма. Роль этого фермента была показана экспериментально: мыши, у которых отсутствует митохондриальная СОД, выживают лишь несколько дней после рождения, так как у них развивается сильный окислительный стресс.
Роль в патологии
правитьМутации СОД1 у человека могут вызывать амиотрофический латеральный склероз, заболевание моторных нейронов. Механизм развития этого заболевания при этих мутациях, однако, не известен, так как ферментативная активность супероксиддисмутазы при этом не изменяется.
Ссылки
править- A.V. Peskin, C.C. Winterbourn. A microtiter plate assay for superoxide dismutase using a water-soluble tetrazolium salt (WST-1) (англ.) // Clinica Chimica Acta[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 293. — P. 157—166.
- Campana, F. Topical superoxide dismutase reduces post-irradiation breast cancer ibrosis (англ.) // Journal of Cellular and Molecular Medicine[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 8, no. 1. — P. 109—116. Free text — PDF 333kB
- Li, Y.; Huang, T. T.; Carlson, E. J.; Melov, S.; Ursell, P. C.; Olson, J. L.; Noble, L. J.; Yoshimura, M. P.; Berger, C.; Chan, P. H.; et al. Dilated cardiomyopathy and neonatal lethality in mutant mice lacking manganese superoxide dismutase. Nat. Genet. 11:376-381; 1995.
- Elchuri, S.; Oberley, T. D.; Qi, W.; Eisenstein, R. S.; Jackson Roberts, L.; Van Remmen, H.; Epstein, C. J.; Huang, T. T. CuZnSOD deficiency leads to persistent and widespread oxidative damage and hepatocarcinogenesis later in life. Oncogene 24:367-380; 2005.
- Muller, F. L.; Song, W.; Liu, Y.; Chaudhuri, A.; Pieke-Dahl, S.; Strong, R.; Huang, T. T.; Epstein, C. J.; Roberts, L. J., 2nd; Csete, M.; Faulkner, J. A.; Van Remmen, H. Absence of CuZn superoxide dismutase leads to elevated oxidative stress and acceleration of age-dependent skeletal muscle atrophy. Free Radic. Biol. Med. 40:1993-2004; 2006.
- Sentman, M. L.; Granstrom, M.; Jakobson, H.; Reaume, A.; Basu, S.; Marklund, S. L. Phenotypes of mice lacking extracellular superoxide dismutase and copper- and zinc-containing superoxide dismutase. J. Biol. Chem. 281:6904-6909; 2006.
См. также
правитьСсылки
править- OMIM 147450 (SOD1), OMIM 147460 (SOD2), OMIM 185490 (SOD3) and OMIM 105400 (ALS)
- Амиотрофический латеральный склероз
- Хороший обзор литературы по СОД.
- Damage-Based Theories of Aging Роль супероксиддисмутазы в старении.
В статье не хватает ссылок на источники (см. рекомендации по поиску). |